Сообщество - Как построить карьеру в науке
Добавить пост

Как построить карьеру в науке

25 постов 624 подписчика

Популярные теги в сообществе:

Как получить PhD грант в Европе

Я очень сильно хотела учиться за границей и иметь престижное образование с хорошими перспективами на дальнейшую работу.

Но жить и учиться за границей - очень дорогое удовольствие и средств у мения для этого не было.


Поэтому после окончания института стала активно заниматься поиском стажировок, PhD грантов и писать профессорам по всей Европе, область работы которых соответствовала моей специальности (искала в основном по биотехнологии). Также подавалась на всевозможные самостоятельные гранты.


Для получения гранта существуют два подхода.



Первый. Поиск профессора.


Вы пишете профессору, если ему нравится ваше CV, он с вами связывается и устраивает интервью по скайпу. Обычно у профессоров есть финансирование с каких-либо грантов и если вы ему понравитесь, то он предложит вам работать у него или совместно подаваться на какой-нибудь грант.


Также он может вам предложить отправить документы в отдел для аспирантов, чтобы там подтвердили, что вы квалифицированы для PhD. (как правило специалитета для поступления достаточно, а если вы учились на бакалавриате, то также требуется магистратура) Для того чтобы добиться результата нужно отправить очень много писем, потому что многие вам откажут. Сделайте это вашей системой, выделите час-два на протяжении дня и каждый день отправляйте определенное количество писем.


Для того чтобы найти профессора заходим на вебсайт института в стране вашего выбора, выбираем кафедру по интересующему направлению – изучаем проекты которыми занимается профессор и смотрим его публикации – отправляем вежливое письмо с высказыванием нашего интереса к проектам, которыми он занимается. В письме нужно указать что у вас имеется опыт по работе с похожим проектом (если он действительно имеется) и отправить CV.



Второй. Поиск грантов.


Сразу скажу, что получить такие виды грантов сложнее, т.к. надо пройти через общий конкурс, а подаются на такие стипендии студенты со всего мира.


Есть две системы по поиску гранта на PhD


1) можно смотреть гранты на сайтах интересующих вас институтов.


Как правило, такие гранты финансируются государством или частными организациями соответствующей страны


Посмотрите в интересующей вас стране список научных организаций по вашему направлению и изучите их сайты, там они должны публиковать информацию о том, когда у них проходят конкурсы на получении стипендии (обычно прием документов заканчивается в январе-феврале).


2)Поиск стипендий на специально предназначенных для этого вебсайтах.


Здесь привожу список сайтов, которые я использовала при своем поиске:


https://euraxess.ec.europa.eu/


naturejobs.com


https://www.lifescience.net/jobs/


http://www.scholarshipportal.com/



Дополнительные ссылки на гранты:


http://gzgu.ru/doc/vo-info/2018/st_Pr.pdf


https://www.daad.ru/ru/stipendien/aspirantura-v-germanii/



Для подачи заявки на грант, как правило, необходимы следующие документы


-CV (я составляла в программе Europass)


При его написании обратите внимание на четкость и понятность написания каждого пункта (образование; опыт работы; личные качества – лидерские качества, навыки коммуникации, хорошая самоорганизация; профессиональные навыки; знание языков; дополнительные курсы; участие в конференциях и т.д.)


Также даже если у вас нет опыта участия в конференциях и конкурсах, начните подаваться на разные дистанционные конференции и конкурсы (особенно международные), куда можете посылать тезисы написанные по материалам вашей дипломной работы. Никто особенно разбираться не будет, что у вас там конкретно написано в каждой публикации, но если увидят, что вы активно участвуете во всяких международных конференциях и конкурсах, это будет большим плюсом.


- мотивационное письмо


Напишите коротко о том, что подтолкнуло вас в вашей жизни заниматься тем, чем вы занимаетесь, что вы умеете делать и самое главное – какую пользу Вы и Ваши знания и навыки сможете принести для проекта и организации куда вы подаетесь. Уделите этому наибольшее внимание в вашем письме.


- переведенный и заверенный диплом


Первое время при переписке с профессорами отправляла неофицально перевод диплома, сделанный мною. В дальнейшем для подачи на гранты уже отправляла официально переведенный и заверенный диплом.


-рекомендательные письма


Как правило, вы сами должны их написать и дать на подпись на место вашей работы/учебы/знакомым ученым. Здесь важно написать о ваших успехах в учебе, о ваших положительных личных качествах, что обладаете мотивацией к саморазвитию и развитию науки, проявляете интерес к постоянному повышению вашей квалификации, участию в конференциях, конкурсах и т.д.



Думайте о том, что если у вас образование обычного университета, ваш шанс при подаче равен примерно 2/100. Поэтому подавайте так много заявок, как только возможно, я за время поиска подала не менее 100 заявок.



Результаты, которые я получила


- соглашение о сотрудничестве с двумя профессорами из Мюнхена и из Барселоны


- грант на стажировку от Фонда Boehringer Ingelheim


- грант на стажировку по Стипендии Президента


- получение гранта DAAD на PhD в Германии


- получение гранта на PhD в Испании



Желаю вам удачи в Вашем поиске гранта за рубежом и буду рада ответить на вопросы или поделиться дополнительными ресурсами, которые вас интересуют.


P.S. Если вы биолог/биотехнолог, буду рада поделиться списком научных институтов в Испании.

Как получить PhD грант в Европе Образование за рубежом, Phd, Аспирантура, Переезд, Бесплатное образование, Бесплатное обучение, Phdays, Длиннопост
Показать полностью 1

Тематика сообщества

На сегодняшний день у сообщества “Как построить карьеру в Науке” 155 подписчиков. Я хотел спросить Вас о направлении и тематики сообщества.



До сих пор я публиковал практические руководства по экспериментальным методам. В планах рассказать больше о работе с иммуногистохимическими образцами и клетками, как пользоваться Zen и лазерным конфокальным микроскопом. Рассказать о Western Blot и как наиболее эффективно использовать этот метод. Однако интересно ли это подписчикам сообщества?


Возможно, мне стоит больше сосредоточиться не на экспериментальных методах, а на административных аспектах жизни исследователя биомедика, собственно о том, как попасть в Ph.D. программу или получить работу постдока за границей. Как писать резюме, о чем спрашивают на интервью и так далее. Мне так же интересно, кто читатели этого сообщества и чего вы ожидаете от этого проекта?

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

Достаточно часто бывают ситуации, когда в лаборатории есть флуоресцентный микроскоп, традиционно оснащённый чёрно-белой CCD камерой (они дешевле, прекрасно справляются с поставленными задачами и обеспечивают более чёткое изображение), но нет подходящего микроскопа для цветной фотографии. Во многих современных научных биомедицинских проектах микроскопия образцов в цвете часто имеет довольно низкий приоритет, а многие гистологические измерения можно выполнить и на основе монохромных кадров. Поэтому PI и не торопятся вкладывать деньги в поддержку цветной микрофотографии.

И все же для ряда окрашиваний цветные снимки бывают нужны. На самом деле сделать цветные снимки можно и с помощью монохромной CCD камеры. Для этого нужно просто разложить свет на цветные компоненты с помощью красного, синего и зелёного фильтров и для каждого канала записать монохромные данные яркости и контраста. Техника открытая более 150 лет назад, английским математиком Джеймсом Максвеллом и хорошо знакомая астрономам.

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

Всё, что Вам потребуется это приобрести цветные светофильтры, которые физически подходят к оптической системе вашей конкретной модели микроскопа. Отличные результаты дают недорогие астрономические LRGB фильтры с ценовым диапазоном от 20-50$, (L-фильтр вам, скорее всего не потребуется), но в качестве импровизации может подойти любой прозрачный предмет нужных цветов, например цветная плёнка или пластик. Чёткость изображения и цветопередача при этом, конечно, может быть ниже.

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

C помощью окуляров нужно найти интересующий ваш участок на срезе и добиться наилучшего фокуса. Дальше не меняя фокуса (на больших увеличениях с объективами 20х+ добетесь оптимального фокуса для каждого фильтра) и положения препарата нужно, последовательно установить красный, зеленый и синий фильтры в микроскоп и для каждого фильтра сделать отдельный монохромный снимок, не забывая, помечать в названии файла с каким фильтром снимок был сделан.

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

Сборку цветных фотографий при этом проще всего производить в Image J. Для этого нужно открыть три монохромных снимка соответствующих красному, зелёному и синему каналу и собрать их цветное изображение с помощью команды Image -> Color -> Merge Channels.

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

Полученное цветное изображение можно сохранить в любом удобном формате и продолжить обработку и кадрирование в любом привычном графическом редакторе. Такую же технику можно использовать для создания цветных снимков на любом монохромном оборудовании.

Снимаем микрофотографии в цвете с помощью чёрно-белой CCD камеры Микросъемка, RGB, Светофильтры, Наука, Imagej, Длиннопост

Микропрепарат человческой роговицы глаза. Окрашивание гематоксилином и эозином, цветное изображение получено сборкой RGB кналов. Микроскоп EVOS FL (Thermofisher Scientific) 05.2107.

Полученные таким образом изображения будут немного более качесвтенные чем полученные с помощью цветной CMOS матрицы со схожими характеристиками, врочем зачастую эта разница малозаметна и не столь важна. Для больших объёмов гистологической работы в цвете, всё-таки стоит приобрести специализированный микроскоп.

Показать полностью 6

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

qPCR - полимеразная цепная реакция в реальном времени эффективный метод определения экспрессии генов, на основе амплификации исходного объёма мРНК. Для выбора генного сектора амплификации требуется пара олигонуклеотидных праймеров 3'-Front и 5’-Reverse, которые помечают участок амплификации. Этот материал расскажет как без особого опыта и знаний создать дизайн праймеров и заказать их синтез.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

http://useast.ensembl.org/index.html

Для начала нужно определить индекс транскрипта для выбранного гена. В этом примере мы рассмотрим ген кодирующий протеин CXCL5 так же нужно выбрать биологический вид, с которым мы работаем, зависит, откуда вы извлекли вашу РНК, в данном примере это мышь CL57BL6. Теперь нажмите "Go" для поиска.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

И из полученного списка важно выбрать не сам ген, он обычно идёт первым в поиске, а именно транскрипт.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Теперь нажимите на транскрипт в полученном списке нужно скопировать Transcript ID в абсолютном большинстве проектов нас интересует протеин кодирующий Protein coding, не содержащий интрона в этом примере Transcript ID следующий: ENSMUST00000031318.5

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

https://lifescience.roche.com/en_us/brands/universal-probe-library.html

Дальше нам на основании полученного Transcript ID нужно определить нуклеотидную последовательность сделать это можно здесь на сайте Roche LifeScience в онлайн системе Universal Probe Library.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Нажмите Assay Design Center и начните с выбора целевого организма. Опять же в данном случае это мышь Mus musculus (Mouse). Теперь впишите в строку Specify your target(s) Transcript ID полученный выше и нажмите Enter или копку Design.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Собственно вот и результат:

CXCL5 3’ tcttgggtgtgttaagagtgttct

CXCL5 5’ cacagcagctttctaaaaccataa


В системе Universal Probe Library прямой праймер 3’ называется left primer, а обратный 5’ right primer, но не суть. Собственно это готовая последовательность qPCR праймеров для синтеза. Чуть ниже сиквенса можно посмотреть карту транскрипта относительно всего гена.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Если вы получили предупреждение об отсутствии интронной сепарации в дизайне праймера, обязательно проведите цикл обработки ваших РНК образцов ДНКазами, для полной фрагментации остаточной ДНК, так как без интронного разделения праймеры могут амплифицировать как cDNA так и обычную ДНК, что может сильно повлиять на конечный результат. Обрабатывать выделенный образец РНК, ДНКазами нужно сразу после извлечения и, разумеется, до синтеза cDNA иначе ДНКазы разберут и её.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Собственно с первым этапом определения Transcript ID можно было бы особенно не заморачиваться, а сразу ввести интересующий нас ген в Universal Probe Library, но тут можно допустить ошибку. Дело в том, что Universal Probe Library предлагает самые разные варианты транскриптов с куда меньшим объёмом сопровождающей информации, закажешь по ошибке не кодирующий или просто не тот конструкт, а потом будешь гадать, почему амплификация не происходит и вместо результатов, qPCR показывает шум. Мелкая ошибка или невнимательность, которая может стоить месяцев работы впустую.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Итак, осталось заказать нуклеотидную последовательность. Фирм которые предоставляют такие услуги множество, выбор часто зависит от того с кем у вашей лаборатории заключён контракт на обслуживание или если на кампусе есть олигонуклеоитидный сиквенсер. Я обычно заказываю через сайт Thermofisher


https://www.thermofisher.com/order/custom-oligo/enterSequences


Всё что нужно это указать название вашего гена, использовать можно только буквы и цифры. Затем нужно вписать название олигонуклеатидной цепи и указать нуклеатидную последовательность. Затем нужно нажать Add Oligo и повторить процесс для обратного праймера. Осталось нажать Add to cart и перейти к оплате. Цена за одну последовательность 5$ при условии, что используется объём в 25 nmole, стандартный режим очистки и доставка в лиофилизированном виде, хотите уже готовый к использованию праймер можно доплатить ещё около 5 долларов и получить готовое разведение, но RNAse free water стоит дешево и лучше разводить праймеры самому. К тому же лиофилизат, хранится намного дольше.


Разумеется, это полностью автоматический режим синтеза праймеров для qPCR, при желании и понимании того как работает процесс амплификации вы можете выбрать другой фрагмент создать свой собственный праймер с интронной сепарацией, протестировать несколько вариантов праймеров с вашим qPCR оборудованием, и так далее для этого существует масса программного обеспечения например https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/, но это тема другого большого поста. Этот гайд больше для тех, кому нужно готовое решение для немедленного практического применения. Определение правильного сиквенса можно опустить и сразу перейти к заказу последовательности, если вы копируете праймеры из уже опубликованной статьи, однако и тут могут быть подводные камни, не всему что опубликовано в научных журналах можно безоговорочно доверять.

Как генерировать и заказывать qPCR праймеры ДНК, РНК, ПЦР, Qpcr, Наука, Праймер, Длиннопост

Удачных амплификаций и чистых результатов.

Показать полностью 11

Как использовать Endnote в научных статьях?

@moderator,

Пост не является рекламным. Я никакого отношения к компании Thomson Reuters Corporation не имею, никого покупать Endnote не призываю. Покупать, искать бесплатные аналоги, качать триал, просить лицензию у своего профессора или качать с torrent, это сугубо личное дело каждого. Пост для научных сотрудников в моё сообщество "Как построить карьеру в Науке". До сих пор множество ученых оформляют цитаты вручную и теряют на этом массу времени, текст для них, исходя из собственного личного опыта.

-----


Работа с цитатами в тексте, особенно если она выполняется вручную, отнимает много времени и сил. Допустим, необходимо добавить цитату в начале текста, это означает, что нужно обновлять всю нумерацию цитат.


Наконец, после долгой монотонной и изнуряющей работы с текстом, статья готова для подачи в журнал, нумерация и формат выверены, но статья получает отказ в публикации, это значит нужно начинать все практически, сначала, и перерабатывать формат каждой цитаты. Учитывая, что разные журналы имеют разные требования к оформлению цитат как в тексте, так и в списке литературы, исправления манускрипта в процессе работы требуют всё новых цитат, а это значит нужно исправлять весь список заново, эта работа отнимает дни, а иногда и недели, авторы допускают ошибки в нумерации цитирования. К счастью, существует способ этот процесс автоматизировать и никогда больше не задумываться о нумерации и формате ваших цитат, перепоручив работу Endnote.


После установки программы возникает резонный вопрос, как же ей пользоваться?

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Открыв свою статью или новый документ в Word, вы увидите, что появилась новая панель инструментов, однако, что дальше? Для начала откройте Endnote, кликнув на красную кнопку EN.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Программа информацию о статьях получает из он-лайн каталогов, по умолчанию настроено соединение с Library of Congress, LISA, Pubmed и Web of Science. Можно добавить и другие, но, как правило, предустановленных достаточно. Разумеется, для загрузки новых цитат программе потребуется подключение к интернет. Теперь, подключившись к Pubmed, давайте найдём статью, которую вы бы хотели процитировать. Система поиска позволяет искать по массе параметров, но сам поиск реализован достаточно не гибко, на точных совпадениях, например, возникают сложности с греческими символами дефисами и так далее. Не будет точного совпадения, поисковый запрос придет пустым. Поэтому если поиск в Endnote не дает результатов это не значит, что статьи в каталогах нет, нужно изменить условия. Например, искать по имени автора, году публикации и названию журнала, нежели названии статьи, либо использовать первые несколько слов названия, вместо полного названия.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Итак, статья найдена, как перенести её в текст?

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Очень просто, кликните на найденном материале. Нажмите Ctrl+C или на Mac: Command + C теперь возвращайтесь в окно Word

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Выберите место, где цитата должна присутствовать. Теперь просто нажмите Ctrl/Command + V, в тексте появится ссылка вида {Authorname, 20XX #00000} если у вас уже определен стиль документа то спустя несколько секунд Endnote отформатирует её в формат указанного журнала, а в конце документа появится список литературы.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Чтобы изменить стиль нажмите на кнопку Format Bibliography на панели инструментов Endnote.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Выберите нужный стиль и нажмите Ok. На этом все, после нескольких секунд работы Endnote приведет ваше цитирование согласно стилю выбранного журнала для примера выберем стиль журнала Cell. Изменять стили можно сколько угодно раз и это займет не более нескольких секунд.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Разумеется, Endnote автоматически исправит нумерацию, если добавить новые ссылки в любую часть текста. Становится возможным вести цитирование по мере написания текста.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Наиболее эффективная для меня схема работы такая: Написать фрагмент текста, к которому нужна цитата, затем в Google найти подтверждающее это утверждение статью или книгу, (часто происходит и наоборот) затем скопировать название или автора в Endnote и добавить цитату в текст.


Если стиля журнала, в который вы хотите подать статью в списке стилей не оказалось, то забиваете в поиск %имя журнала% Endnote style и качаете ens файл.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё
Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Его вам нужно скопировать в C:\Program Files (x86)\EndNote X6\Styles (потребуются права администратора).

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

После чего, программу даже не нужно перезапускать, нужный стиль отыщется в разделе Format bibliography/Browse.

Как использовать Endnote в научных статьях? Длиннопост, Цитаты, Наука, Phd, Моё

Разумеется у программы есть масса других функций, но начать эффективно пользоваться автоматическим менеджментом цитат можно согласно этому руководству. А на сэкономленное таким образом время можно провести больше экспериментов или почитать pikabu.


Удачных открытий и публикаций!


P.S. Специфическая проблема для русских пользователей отсутствие научных работ на русском языке во многих он-лайн каталогах. Задумайтесь вот над чем, статьи на локальных языках обладают минимальным научным весом, они вряд ли посодействуют вашей научной работе.

Показать полностью 13

Научные позиции в США по визе J-1 стоит ли связываться?

Многие научные учреждения США достаточно легко принимают на работу постдокторантов по программе J-1. Все что требуется это сравнительно недавно (5 лет и менее) оконченная Ph.D, зачастую хватает даже русской аспирантуры и несколько публикаций в международных журналах. Казалось бы, вот она: карьера в крупном или не очень американском научном центре. Однако не спешите радоваться и подписывать контракт. Дело в том, что виза J-1 имеет под собой одно очень важное ограничение: это так называемое “2 years home residency” - “Требование двухлетнего пребывания в стране гражданства” или коротко 2YHR, под девизом: "Обязанности участника делиться полученным в США опытом в своей родной стране". Вот тут и возникают проблемы. Программа позволяет работать в США до 5 лет в рамках научного учреждения, с которым вы заключили контракт. Это достаточно длительный срок, люди за это время обрастают вещами, машинами семьями и так далее. После чего, вам даются бонусные 30 дней на завершение дел и настоятельно просят покинуть США, чтобы не стать нелегальным иммигрантом.  Ваши научные достижения за этот период не будут играть почти никакой роли. Да, теоретически ваш PI может помочь вам в США остаться, если вы проявите себя, на это вам конечно же намекнут еще в начале вашей программы, но в действительности это случается достаточно редко. В итоге после продуктивного постдстока вы оказываетесь перед необходимостью покинуть США и провести 24 месяца в России, где найти подходящую научную позицию будет совсем непросто, в результате возникает “карьерная дыра” длинной в 2 года, после которой получить научную позицию становится еще сложнее. Семейные и по большом счёту любые другие обстоятельства, дети, жены и мужья даже если они граждане США, ничем не смогут вам тут помочь. С позиции иммиграции ничто не мешает вашему супругу или супруге пожить с вами в России пару лет. Действительность конечно же намного более сурова.  


Разумеется такая ситуация далеко не конец света, есть много стран и множество интересных позиций, однако работа в США для вас на этом фактически завершится, так как проживая вне территории страны вашего гражданства, уменьшить срок 2YHR невозможно. Правда в этом случае есть ещё возможность вернуться спустя 2 года в США опять на 5 лет по ещё одной визе J-1, (после окончания J-1 программы получить новую J-1 можно спустя 24 месяца, но без условия проживания в стране гражданства), однако, при этом срок вашего пребывания в стране гражданства вырастает до 4 лет и проблему не решит. Разумеется получить J-1 позицию после 7 лет от окончания аспирантуры – довольно непросто.


Очень важный фактор - это источник вашего финансирования, если в США вас направили по визе J-1 от вашего университета в России в статусе Special Volonteer и русская сторона оплачивает ваше пребывание в США, то при этом 2YHR можно достаточно легко снять через “No objection waiver” от Русского посольства в Вашингтоне Округа Колумбии. Однако если вы получили финансирование от правительства США, то отделаться от 2YHR практически невозможно, за исключением всякой экзотики, вроде страха расправы на родине из-за оппозиции к властям, нетрадиционной сексуальной ориентации или религиозных предпочтений.


Поэтому J-1 позиции нужно рассматривать очень осторожно и правильно планировать вашу дальнейшую жизнь и научную карьеру. Если возвращение в Российскую научную группу после года-двух работы в США и является вашей целью, то ничем особенным 2YHR вам не повредит к идее иммиграции в США уже в более перспективной роли Assistant Professor, Staff Scientist или даже попытаться получить свою лабораторию можно позднее. Однако если ваша цель в США иммигрировать и устроить жизнь своей семьи, то лучше позиций J-1 избегать и сразу искать позиции H1B1 которые позволяют в США иммигрировать. Получить такие позиции намного сложнее и требуют они более весомого научного багажа, чем обычно бывает у молодого ученого, однако они избавят вас от ряда проблем на более поздних этапах карьеры.

Показать полностью

Набор софта для биомедицинского исследователя или какие лицензии требовать у профессора или PI?

Получив свой первый рабочий laptop, и обнаружив в лучшем случае пакет MS Office (если нет Office но ваш университет подписан на сервисы Microsoft Outlook скорее всего офис можно будет установить бесплатно чрез ваш аккаунт), стоит задуматься какой пакет приложений вам понадобится для работы. В зависимости от университета и ваших отношений с завлабораторией, программы нужно либо выпрашивать лицензионные, либо доставать из других источников. При этом нужно быть осторожным, особенно в США, так как за тот же не лицензионный Photoshop на рабочем компьютере можно запросто вылететь с позиции.


Платные

Photoshop – абсолютно незаменим, для работы с изображениями, приготовления фигур в статьях и презентациях. Можно использовать и для научных измерений, например измерения расстояний, калибровке каналов иммунофлуоресцентных фотографий и так далее. Не ведитесь на более дешевую лицензию Photoshop Elements функционал там под науку не заточен. Если за лицензию придется всё-таки раскошеливаться самому постарайтесь получить академическую скидку.

http://www.adobe.com/


Endnote – настолько упрощает работу с цитатами, программа чуть-чуть не очевидна в применении. Но после работы с Endnote вернуться к ручной правке цитат становится просто невозможно. Чуть позже напишу подробно, как им пользоваться. Как и Photoshop можно сильно сэкономить на академической лицензии.

http://endnote.com/


GraphPad Prism 5 – один из лучших, на мой взгляд, пакетов для построения графиков и статистической обработки, позволяет устанавливать статистические связи прямо внутри вашего графика, которые будут изменяться, если изменяется data set. При минимуме усилий создает профессионально выглядящие графики, которые на ура принимают в зарубежных журналах (при соответствующих данных, разумеется). Позволяет экспортировать растровые изображения высокого разрешения, что очень удобно для публикаций. Готовые графики, как правило, либо не требуют доработки вовсе, либо самый минимум в Photoshop.

http://www.graphpad.com/


FlowJo – пожалуй, лучшее приложение для работы с данными для flow cytometry. Понадобится, если только вы работаете с Flow Cytometry. FlowJo открывает практически все форматы данных потоковых цитометров на рынке. Программа требует некоторой сноровки в применении. Несколько позже о ней напишу отдельно.

https://www.flowjo.com/



Бесплатные и условно бесплатные.

Image J – мультитул от Национального Института Здоровья США. Не самая user frendly программа, но позволяет открывать многие форматы файлов, проводить измерения, автоматически подсчитывать объекты на фотографиях и многое другое. Советую использовать вместе Youtube руководствами для решения специфических задач.

https://imagej.nih.gov/ij/



Zen Light – позволяет работать с czi файлами Карл Цейсовских микроскопов. По возможности всегда сохраняйте ваши фотографии в czi так можно потом очень удобно работать с каналами. Проводить измерения размеров и многое другое. При сохранении в tiff очень многие метаданные теряются. Разуется имеет смысл иметь только если в вашей лаборатории или core facility есть микроскопы которые работают с этим форматом.

http://www.zeiss.com/microscopy/us/downloads/zen.html



NIS Viewer – практически, то же самое, что и Zen Light, но для микроскопов Nikon.

https://www.nikoninstruments.com/en_EU/Products/Software/NIS-Elements-Advanced-Research/NIS-Elements-Viewer



Biorad Image Lab – если работаете с любым из хемилюминесцентным или флуоресцентными imager от Biroad. Если есть устройство со Stain Free очень удобно делать автоматическое распознание сигналов и маркеров с автоматической же нормализацией. Если Stain Free нет, то работает достаточно плохо, но нужна, для конвертации изображений в более привычные tiff.

http://www.bio-rad.com/en-us/product/image-lab-software


Notepad++ - для удобной работы с протеиновыми или нуклеотидными сиквенсами. Пригодится так же для очистки текста от форматирования, особенно если копируете фрагменты текста и браузера в Word. Просто скопируйте предложение в Notepad, текст останется, а форматирование пропадает.

https://notepad-plus-plus.org/


Team Viewer – спасет массу времени и нервов, когда какие-то файлы оставались на рабочем компьютере, а нужны они прямо сейчас или наоборот. Очень помогает, когда нужно загрузить статью из университетской сети, а при работе из дома за статью просят деньги, так как адрес не покрыт библиотечной подпиской организации. Для личного пользования программа бесплатная. Тоже следует ознакомиться с правилами безопасности сети университета, в некоторых учреждениях за Team Viewer можно огрести.

https://www.teamviewer.com


Предлагайте ваши варианты и альтернативы в комментариях.

Показать полностью

Аспирантура - время безграничных возможностей

Аспирантура - время безграничных возможностей Аспирантура, Стипендия, Социальное, Забота, Красный и Синий, Юмор, Диплом
Показать полностью 1
Отличная работа, все прочитано!