Про стволовые, кроновые и тотальные группы (и их условность), а также другие термины кладистики (но не все)
Справочник для ЛЛ:
Клада — группа, включающая общего предка и всех его потомков. Только такие группы допустимы кладистикой и считаться таксонами.
Sensu lato — в широком смысле.
Sensu stricto — в узком смысле.
Монофилетическая группа (монофилия) — группа, включающая общего предка и всех его потомков. Единственные допустимые кладистикой таксоны.
Примеры: Млекопитающие, Амниоты, Амфибии sensu stricto.
Парафилетическая группа (парафилия) — группа, включающая общего предка, но исключающая часть его потомков. НЕдопустимые кладистикой таксоны, но допустимы эволюционной таксономией.
Примеры: Рептилии (исключают птиц и млекопитающих), Амфибии sensu lato (включают всех четвероногих, за исключением Амниот), Рыбы (включают всех первично водных позвоночных/челюстноротых, кроме Четвероногих), Ящерицы (включают всех Чешуйчатых, кроме змей. Сейчас доказанно, что змеи являются родственницами игуан и веретениц, из-за чего начали включать в кладу Toxicofera).
Полифилетическая группа (полифилия) — группа, включающая таксоны, образованные путем конвергентной эволюции (сходство, образованное адаптацией к одинаковым условиям существования у неродственных линий). Проще говоря, группа из неродственных организмов. НЕдопустимы как и кладистикой, так и эволюционной таксономией. Часто возникали при сравнении схожих признаков у различных групп организмов, которые оказались лишь поверхностными.
Примеры: Теплокровные животные (теплокровность независимо возникала у некоторых лучеперых рыб, архозавров и терапсид, могла быть исходной для амниот), Лишайники (симбиоз с водорослями возникал множество раз как и у Базидомицетных грибов, так и у Аскомицетов), Живородящие ящерицы (живорождение очень распространено среди Чешуйчатых, и возникало чуть ли не во всех крупных подгруппах).
Сестринские таксоны — таксоны, появляющиеся после разделения общего предка на несколько подгрупп.
(Уважением всем тем, кто это не читал).
Тотальная группа — группа, включающая кроновые и стволовые группы одновременно. Классический пример — Сиегоцефалы, включают Четвероногих и таксоны, не попавшие в краун-группу Четвероногих.
Синапсиды и Завропсиды являются сестринскими по отношению ко друг-другу, а также тотальными по отношению к рептилиям (для Завропсид), млекопитающим (для Синапсид) и их стволовым группам, входя в краун-группу Амниот, которая сама входит в тотальную группу Рептилиоморф и так далее.
Определение стволовых и кроновых таксонов возможно одним фактором — существованием в наши дни.
Стволовая группа (она же стем-группа) — таксоны тотальной группы, не попавшие в кроновую (просто не дожили). Стем-группа по определению парафилетическая, однако, широко используется среди кладистов как неформальное объединение, и таксоном НЕ является. Включает таксоны, не попавшие в кроновую группу, т.е. банально не дожив. Например, стволовыми считаются Стегоцефалы, вроде ихтиостеги, не попавшие в дожившую группу Четвероногих.
Стем-группы могут быть даже у краун-групп.
Кроновая группа (она же краун-группа) — таксон, включающий ВСЕ дожившие до наших дней сестринские группы. Формируется после разделения таксона на таксоны меньше за объемом. Млекопитающие — краун-группа Синапсид, а Рептилии (включая Птиц) — краун группа Завропсид. Иногда, краун-группы могут включать в себя не более одного вида, вроде гаттерии внутри Клювоголовых. А сами Клювоголовые являются сестринским таксоном для чешуйчатых, формируя тотальную группу Лепидозавроморфов, которая также включает стволовые таксоны, не входящие в одну из современных групп Лепидозавров.
Кроновые группы часто определяются появлением современных сестринских таксонов. Таким образом, краун-группа Стегоцефал сформировалась после разделения Четвероногих на Батрахоморф (Амфибии sensu lato) и Рептилиоморф (Амниоты sensu lato).
Единственный таксон, для которого нет своей стем-группы — Жизнь.