Серия «Вирус»

Вирус (6)

Заканчиваем знакомиться с книгой Аниты Чан и Мэтта Ридли "Вирус. Поиск происхождения Covid-19".

Все части сложены здесь.


Коротко для ЛЛ: нулевая гипотеза остаётся в силе: вирус мог прийти из дикой природы. Но слишком много концов не сходится. Авторы считают лабораторную утечку более вероятной. С течение времени всё больше людей согласны с ними. Рано или поздно правда выйдет наружу.


Представим себе судебное заседание, на котором стороны представляют естественную и лабораторную версии происхождения пандемии коронавируса. Начнём с аргументов первой стороны. Слово предоставляется адвокату естественной версии происхождения пандемии.


- Уважаемые дамы и господа! Естественное происхождение пандемии коронавируса является нулевой гипотезой, предположением по умолчанию. Так было с предшественником ковидного вируса - SARS. Спустя годы после эпидемии 2003 годаучёным удалось найти носителей в дикой природе. Другие вирусы, передавшиеся от летучих мышей, такие как MERS, эбола, нипах или хендра, тоже не вызывали споров в этом смысле. Да, никто не заразился на пути вируса из южного Китая в Ухань. Но это не невозможно. Какой-нибудь торговец нелегальной дичью, везущий свою добычу ночами к себе на уханьский рынок, мог заразиться сам и не заразить никого по дороге.


Но это точно не было замороженное мясо. В предполагаемой цепи снабжения до сих пор нигде не обнаружили вирус. Особенно в местах заморозки. Более того, совершенно неясно, можно ли вообще подхватить ковид от замороженного продукта.


Отчего же такая тотальная скрытность китайцев? Очень просто: никто не хочет быть наказанным. Вообще, трудно представить себе, чтобы авторитарная система реагировала на нештатную ситуацию публикацией информации. Похожую реакцию можно было лицезреть во время эпидемии SARS, а у неё точно были естественные причины.


Исходя из того, что ковидом-19 могут болеть и животные, нельзя сказать, что вирус был приспособлен исключительно для человека. Геном пандемийного вируса не был обнаружен в лабораториях. Ближайший родственник SARS-CoV-2 схож с ним на 96%. Это мало, чтобы рассматривать его как прототип. И ни одно исследование, отрытое интернет-детективами в Сети не указывало на исследования предшественника возбудителя пандемии в лаборатории. Далее, с течением времени учёные находят всё больше родственников в дикой природе. И если на рынке морепродуктов ничего не нашли, это не значит, что там ничего не было. Могли спрятать до обыска, сразу, как стало известно об эпидемии.


Да, сайт расщепления фурина (СРФ) не встречался в семействе SARS. Но встречался у других коронавирусов, которыми тоже болеют летучие мыши. И вообще, прямых свидетельств лабораторной утечки - ноль. Их нет. Ни записей об аварии, ни сообщений от анонимных источников или случайных свидетелей. Китайский режим - авторитарен, но не всемогущ.


Вот и получается, что все эти онлайн-детективы и им подобные в поисках хайпа, денег и прочих плюшек клевещут на добросовестных учёных, работающих на благо мира. Короче, не надо наводить тень на плетень и искать заговор там, где его нет. Потому давайте останемся при нашей нулевой гипотезе. Время всё расставит на свои места, когда мы найдём где-нибудь в далёкой пещере источник пандемии.


Теперь слово стороннику лабораторной версии.


- Ваша Честь! Сразу нужно сказать, что речь не идёт о намеренном выпуске вируса в человечество китайскими властями. Уханьские учёные изучали вирус с целью предсказания пандемий и возможной разработки лекарств и вакцин. Но что-то пошло не так, и вирус ускользнул из лаборатории, заразив сотрудника или попав в город с плохо очищенным мусором. Такие случаи, хоть и редки, но всё же случаются достаточно регулярно.


Далее, природный источник пандемии до сих пор не найден. А время идёт. После эпидемии SARS в 2003 году учёные довольно быстро напали на след. Не то, что сейчас.


Отсутствует объяснение и того, как вирус смог так быстро приспособиться к организму человека, что существенное время оставался генетически стабильным. Это потом уже, когда заразились миллионы, стали расходиться его штаммы.


Почему китайские власти чинили препятствия и не предоставили исходных данных комиссии ВОЗ? Если бы они хотели разрушить лабораторную версию, им бы надо было наоборот, раскрывать двери и журналы всех возможных лабораторий для инспекции.


И, наконец, почему Ухань? Может, потому, что для вируса из заброшенной шахты попасть туда было легче всего в багаже учёного? Мы знаем, что в распоряжении Уханьского института вирусологии (УИВ) была целая коллекция похожих вирусов из Моцзяна, что они изучались и при этом оставались неопубликованы.


А эта завеса секретности вокруз моцзянской шахты с перекрытыми дорогами и патрулями? А удалённая из общего доступа ещё осенью 2019 база данных с вирусами?


Если бы исследователи просто изучали эти опасные штаммы - это было бы ещё полбеды. Но они ведь клонировали их, мастерили из них ещё более смертоносные химеры и заражали ими лабораторных животных. При этом намеренно создавая организмы, представляющий опасность для всего человечества. И это только то, что известно из открытых источников, но были ведь и секретные исследования.


Но в любом случае, совсем не обязательно, что из лаборатории вырвалась химера, а не природный вирус, как бывало уже не раз. Материала-то в холодильниках УИВ хватает: у них крупнейшее в мире собрание.


Если посмотреть на сам вырвавшийся вирус, то в глаза бросается его особенность, ярко выделяющаяся на фоне его семейства: СРФ. Притом что сами китайские специалисты отказывались замечать его в своих ранних анализах генома.


Неудивительно, что при появлении всё новых несоответствий лабораторная версия находит всё больше сторонников не только в рядах борцов-одиночек, но и в рядах научного сообщества. Многие вирусологи изменили свою точку зрения и сочли для себя естественную гипотезу менее вероятной: у неё всё так же мало свидетельств, а пространственная близость источника пандемии к крупнейшему в мире собранию коронавирусов наводит на размышления.


Положа руку на сердце, разобраться в причине пандемии необходимо хотя бы для того, чтобы случившееся не повторилось. Нет смысла спихивать бремя доказательства на противоположную сторону. Ко всем версиям надо предъявлять одинаковые требования.

Вот четыре возможных пути передачи вируса от летучей мыши жителям Уханя:


1. Посредством промежуточного носителя: виверра, панголин и т.п.

2. Через заражение местного жителя, вступившего в контакт с летучей мышью.

3. Через заражение учёного, собирающего пробы.

4. Происшествие при лабораторных исследованиях.


Даже если подтвердится один из первых двух путей - опасения авторов касательно сбора, хранения и модификации патогенов в лаборатории всё равно останутся в силе. Если же окажется, что была утечка из лаборатории (к чему склоняются авторы книги) - по репутации науки будет нанесён серьёзный удар. Жизненно важные исследования привели к неслыханной пандемии - какой ужас... Этот удар вряд ли ограничится одной лишь вирусологией, а затронет другие спорные отрасли науки. Придётся согласовывать более строгий и прозрачный режим касательно исследований патогенов.


Да, это будет неприятно. Но если настоящая пандемия останется нерасследованной, это откроет дорогу многочисленным недобросовестным деятелям, которые поймут, что создание и выпуск опасных патогенов может сойти с рук.


Лето 2021 года послужило поворотным пунктом, и лабораторная версия стала признаваться всё большей частью американской публики в качестве вполне вероятной гипотезы. Её уже не считали антикитайской фантазией крайне правых. Даже доктор Фаучи признал, что он "не убеждён" в естественной версии. Авторы книги почувствовали внезапный интерес публики к собственным персонам. Их раз за разом просили дать комментарий на ту или иную тему. Стала смягчаться цензура. Фейсбук обратил свою политику цензирования сообщений о лабораторной версии. Vox стал по-тихому редактировать статьи, отвергающие её. Даже "Нью-Йорк Таймс" прогнулась и выпустила глубокий обзор на тему лабораторной утечки. Да что говорить: 9 августа про утечку написала китайская Global Times! Правда, они катили бочку на лабораторию доктора Барича.


А 9 сентября The Intercept опубликовал слив документов с описанием проектов EcoHealth Alliance и WIV, которые подтвердили то, что нарыли самодеятельные интернет-детективы: и работы с сарбековирусами в лаборатории невысокого класса безопасности, и непревзойденную коллекцию вирусов в Ухане, и описание процесса сбора проб в "злачных местах", и тестирование химер на гуманизированных мышах. Ещё через неделю анонимный источник слил ещё один чрезвычайно интересный документ: предложение американскому оборонному агенству DARPA профинансировать исследование ( с Дашаком, Ши Чжэнли и Линфой Ванг в составе участников) потенциала распространения опасных вирусов. Самое интересное: в этом предложении был описан план по внедрению СРФ в рукотворный сарбековирус. Они собирались это делать уже в 2018 году!


Хотелось бы ошибаться, но есть основания утверждать: два десятилетия интенсивных исследований генома сарбековирусов привели не к новой вакцине, а к пандемии. С самого начала которой китайские учёные и чиновники в компании с учёными всего мира старательно пытались предотвратить расследование того, что произошло. Если произошедшее не послужит нам уроком - всё повторится уже с новым вирусом. Авторам остаётся надеяться, подобно шекспировскому Ланчелоту:

В конце концов правда выйдет наружу...

-------------------------


Увы. Судебного заседания не будет. Слишком мало улик и сильно лобби. Непохоже, что кто-то будет делать выводы и ограничивать лабораторные практики. Будут новые джинны из пробирки, и новые пандемии с жертвами, если порочные практики не прекратятся. Когда-то грянет гром, но вряд ли скоро...

Показать полностью

Вирус (5)

Продолжаем знакомиться с книгой Аниты Чан и Мэтта Ридли "Вирус. Поиск происхождения Covid-19."

Все части сложены здесь.


Коротко для ЛЛ: ковидный вирус содержит одну уникальную особенность, которую китайские исследователи умудрялись не замечать в своих отчётах. Также у него нашлось несколько родственников из заброшенной шахты, о которых тоже умалчивалось. Комиссия ВОЗ возвестила миру о замороженном мясе, как источнике ковида, но ей мало кто поверил.


Геном ковидного вируса содержит 29 тысяч букв, то есть нуклеотидов. Но лишь о дюжину из них разбилось большая часть копий в дебатах касательно происхождения вируса. Это маленький, но важный кусочек. Он делает вирус более заразным, является уникальным во всём семействе сарбековирусов, а главное: находится точно там, куда его сажают генные инженеры в своих исследованиях.


Его название: сайт расщепления фурина (СРФ). Код: CGG-CGG-GCA-CGT. И кодируется им последовательность аминокислот RRAR. Шип коронавируса определяет, в какую клетку может зайти вирус. То есть он является чем-то вроде ключа, отмыкающего определённый рецептор. Если этот рецептор - ACE-2, то вирус может инфицировать широкий спектр тканей человека, например. У многих пропадает обоняние потому, что в носовой полости поражены клетки с этим рецептором. Но чтобы ключ подошёл к замку, его надо активировать. То есть расщепить в двух местах. В результате шип распадается, как оригами, на букет. Первая ветка, S1 - присоединяется к рецептору. Вторая, S2 - помогает мембране вируса слиться с клеточной мембраной хозяина. S2 впоследствии сама расщепляется на две ветки, и это способствует проскальзыванию генома вируса внутрь клетки.

Вирус (5) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Политика, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Активация шипа коронавируса


Что это за ножнички, активирующие шип и кто их предоставляет? А мы сами, точнее наши клетки. Эти ферменты, которые называются протеазы, нужны нам для трансформации собственных белков. Вот и имеются в нашем теле в изобилии.


Как видим, это очень эффективный способ зайти в клетку. Он придаёт вирусу пандемийный потенциал. И коронавирусы им пользуются. Но только не из семейства SARS! Вернее, один из семейства имеет такую фишку. Догадайтесь, какой...


Открыли СРФ в далёком уже 1992 году и с тех пор пытаются "играться" с ним, вставляя туда, где его нет. Пытаются окончательно понять, как он работает. За пятнадцать лет в шип коронавируса его вставили как минимум пять раз! Это стало чуть ли не модой, за которой гнались и Бэтвумен с доктором Баричем. Они вставляли СРФ в MERS-вирус, например.


Удивление вызывает и чрезвычайно редко встречающаяся комбинация CGG-CGG. Одним из первых обратил на это внимания "динозавр" вирусологии доктор Балтимор, который назвал это место "дымящимся пистолетом", намекая на то, что это может указывать на искусственное происхождение SARS-CoV-2. Одним из деятельных участников дискуссий на этот счёт был Юрий Дейгин. Он утверждал, что участвовал в проекте, в рамках которого эта комбинация искалась в геномах всех сарбековирусов, и нигде, крому СРФ у пандемийного вируса, больше не нашли. Стоить заметить, конечно, что всё же есть шанс, что это сделала мать-природа.


Самое подозрительное в истории с СРФ - поведение Бэтвумен и её команды. Уже в январе 2020 года они первыми выпустили обширные комментарии декодированного генома SARS-CoV-2. Они описали кучу разных свойств, но ни одним словом не обмолвились о СРФ, который является наиболее значительным отличием пандемийного коронавируса от других SARS-вирусов. Это, как если бы, открыв единорога, в описании они описали только лишь копыта и хвост. Учитывая популярность исследований по вставке СРФ, это умолчание выглядит, мягко говоря, очень странным.


После публикации китайскими учёными фрагментов генома RaTG13 - ближайшего родственника SARS-CoV-2, возникло ещё больше вопросов. Онлайн-детективы (главным образом Франсиско де Рибера и некто с Твиттер-ником Babarlelephant) смогли выстроить и проанализировать филогенетическое дерево сарбековирусов по китайским данным.

Вирус (5) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Политика, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Фрагмент дерева Barbarlelephant. SARS-Cov-2 - зелёная стрелка, RaTG13 - синяя.


Они нашли в нём место RaTG13. Но он оказался там в соседстве с ещё восемью непонятными вирусами . Рибера спросил о них прямо у доктора Дашака. В ответ получил блок на Твиттере. Дальнейшие поиски с помощью уже известного нам индийского Seeker-а позволили сделать вывод, что и RaTG13, и восемь таинственных соседей в дереве происходят из той самой заброшенной шахты в Модзяне, где заразились и заболели шахтёры в 2012 году. Но собраны они были годами позже. После публикации их выводов китайцы, по-видимому, решили, что отпираться нет больше смысла и осенью 2020 года опубликовали приложение к статье в журнале Nature, где содержалось подтверждение большинства выводов онлайн-детективов. В том числе упоминались те самые восемь вирусов, происходящие из того же места, что и RaTG13. Упоминались, не более. Никаких указаний на степень родства, ничего. Прошло ещё полгода, прежде чем, наконец, были опубликованы их геномы.


Вдумайтесь: уханьские учёные собирают эти вирусы, годами изучают их, а когда начинается пандемия с весьма похожим вирусом - молчат, как рыба.


Последние фрагменты пазла были сложены после анализа ещё нескольких китайских диссертаций. Из одной из них, датированной июнем 2019 года, выяснилось, что уханьские учёные идентивицировали четыре различных линии SARS-вирусов. Сегодня мы знаем, что SARS-CoV-2 принадлежит к четвёртой линии (как и восемь вирусов из Модзяна), а вирус, вызвавший эпидемию 2003 года, например, - к первой. Что интересно: сходное древо уже было опубликовано в одной из диссертаций ещё раньше. Вот только четвёртая линия в ней вообще отсутствовала. Похоже, сокрытие информации началось задолго до пандемии.

Вирус (5) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Политика, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Франсиско де Рибера, испанский инженер, по совместительству онлайн-детектив


Как видим, самозваные онлайн-детективы помогли пролить свет на то, что предшествовало пандемии. А что же расследование ВОЗ? Что выяснили видные учёные, которые за свои поиски деньги получают? Эта организация с самого начала следовала по китайскому фарватеру. Они признали возможность передачи вируса от человека к человеку лишь в последней декаде января 2020 года. Пандемию объявили 11 марта года. Эксперты организации жаловались в частном порядке на скрытность китайской стороны. В ноябре 2020 года организация честно призналась в своём официальном документе, что происхождение вируса по-прежнему окутано тайной, что естественное происхождение не имеет подтверждений, равно как и "рыночная" гипотеза. При этом возможность лабораторной утечки была не упомянута.


Команда для расследования комплектовалась из специалистов ВОЗ и из китайских участников и подлежал одобрению китайскими властями. Туда вошли и те, кто затушёвывал ситуацию, и даже известный нам доктор Дашак. Пустив козла в огород, трудно надеяться на добрый урожай. Первая фаза расследования, сфокусированная на эпидемиологии прошлых случаев, базировалась на предварительные исследования китайских учёных. Включая отбор и анализ проб, проверка больничных записей и интервью с ранними пациентами. Когда наступило время ехать в Китай, оказалось, что экспертам не дали визы. В конце концов 14 января 2021 года они вылетели. И залетели в двухнедельных карантин, где, они, наконец, смогли ознакомиться с тем, что наработала китайская сторона расследования до того времени. После этого последовало 12 дней строго контролируемых визитов в заранее установленные места и интервью с заранее отобранными людьми.


9 февраля была созвана трехчасовая пресс-конференция, на которой была оглашена главная версия: вирус прибыл в Ухань в замороженном мясе или рыбопродуктах. То есть где-то в южном Китае или прочей Азии какое-то животное подхватило коронавирус от летучей мыши, а потом было зарезано и завезено в замороженном виде за сотни километров в Ухань. Лабораторная же версия была признана "чрезвычайно маловероятной" и недостойной для дальнейшего рассмотрения. Из двух недель пребывания ей посвятили пару часов 3 февраля, в течение которых комиссия посетила свежепостроенную уханьскую лабораторию высшего уровня безопасности. В то время, как большинство исследований с коронавирусами было в других лабораториях, одним или даже двумя уровнями ниже. Не лишне упомянуть, что эти лаборатории территориально намного ближе к рынку морепродуктов, чем новый кампус, где была с визитом комиссия.

Вирус (5) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Политика, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Пресс-конференция 9 февраля 2021 года.


Когда эксперты комиссии пытались получить доступ к "сырым" данным, особенно касающихся первых случаев ковида в Ухане, им было в этом отказано. Пришлось анализировать только то, что было разрешено им показать. Это значило, что результаты комиссии практически невозможно подвергнуть независимой проверке. Но и без этого позднее в 2021 году в отчёте комиссии было найдено несколько серьёзных ошибок. Об этом сообщила Вашингтон Пост. Подход при идентификации был предвзят в сторону рыночной гипотезы. Ранние случаи заболевания были отобраны уханьскими врачами, проверены шестью китайскими экспертами и лишь после этого переданы комиссии. Отсев был жёстким. Но даже эти данные позволяли предполагать датирование первых случаев заражения сентябрём 2019 года! А в декабре, по-видимому, уже были тысячи случаев. Без полного доступа к данным точное датирование невозможно.


Но кое-что комиссии определённо удалось выяснить. Они не нашли SARS-CoV-2 в дикой природе провинции Хубэй, центром которой является Ухань. Отсюда - рыночная версия. На рынке морепродуктов в самом деле продавались животные, потенциально могущие быть промежуточными носителями вируса. Хоть их там в то время было немного. Не говоря уже о панголинах, которых там вовсе не было.


Западная пресса откликнулась на отчёт ВОЗ откровенно скептически. Некоторые эксперты не верили, что китайские учёные сами не провели даже рудиментарных исследований по поискам происхождения вируса. Доктор Дашак сказал CNN, что фермы на юге Китая до сих пор не проверялись специалистами. 30 марта 2021 года вышел полный отчёт, на который западные правительства отреагировали выражением "совместной озабоченности". Генеральный директор ВОЗ доктор Тедрос заявил о необходимости дальнейшего расследования лабораторной версии. Об этом заявили и подписанты открытого письма в журнал Nature:

Мы должны серьёзно относиться и к естественной, и к лабораторной гипотезам до тех пор, пока не получим достаточно данных.

Удивительно, но факт: письмо подписал также не кто иной, как... доктор Барич, тесный партнёр Бэтвумен aka доктор Ши Чжэнли. Он открыто признал, что нахождение института вирусологии в месте возникновения пандемии - это проблема.


Как ни крути, а результатом расследования ВОЗ стал не ответ на вопрос о происхождении пандемии, а включение в поиски ведущих учёных и журналистов всего мира.


-------------------


Всё. Фактура закончилась. Мы не увидим в книге новых доводов, проливающих свет на эту загадку. Я залез на днях в Твиттер Алины Чан и не нашёл там ничего особо нового в этом плане. Осталось делать выводы из того, что имеем. Об этом - в заключительной части.

Показать полностью 4

Вирус (4)

Продолжаем знакомиться с книгой Аниты Чан и Мэтта Ридли "Вирус. Поиск происхождения Covid-19."


Все части сложены здесь.


Коротко для ЛЛ: в последнее время вошло в моду синтезировать всё более вредоносные патогены под предлогом профилактики эпидемий. Попытки запретить это провалились. Пандемия могла начаться в результате утечки продукта таких исследований.


Исследования по усилению вирулентности патогенов ведутся уже давно. Ещё десять лет назад учёным из Токио и Роттердама удалось заставить распространяться высокопатогенный птичий грипп H5N1 воздушным путём. Это не были какие-нибудь биотеррористы в секретных лабораториях, а добросовестные исследователи. Намерения были самые добрые: выяснить, способен ли вирус представлять угрозу для человечества, и если да, то на какие мутации следует обращать внимание. Облегчения результаты не принесли, скорее наоборот - породили волны страха. Слишком легко у них получилось. Что будет, если третья, четвёртая лаборатория займутся этим? Многие учёные забили тревогу, требуя запретить такие исследования, получившие название Gain-of-function. Даже те самые исследователи из Японии и Нидерландов объявили 60-дневный мораторий. Без шансов. Слишком много хайпа светило в этой новой области. Через год к клубу усилителей птичьего гриппа присоединились китайцы.


Ещё через два года в американских лабораториях произошло три нештатные ситуации с оспой, сибирской язвой и птичьим гриппом. Белый дом призадумался, а в октябре 2014 года объявил о моратории на финансирование исследований усиления функции. Знаменитый вирусолог Ральф Барич пожаловался, что реагировать на эпидемии будет в таких условиях непросто. Но он сам же высказывал опасения касательно попадания патогенов в руки террористов.

Вирус (4) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Биологическое оружие, Исследования, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Доктор Барич


Доктор Барич - легендарная личность в кругах вирусологов. В своих исследованиях он использует "бесшовный" метод редактирования генома, не оставляющий следов вмешательства человека. Этим методом пользовался и УИВ как минимум с 2016 года. Так что говорить, что отсутствие следов редактирования - весомый аргумент в пользу естественного происхождения SARS-CoV-2 - мягко говоря, лукавство.


В редактировании генома патогенов отметилась и Бэтвумен. Уже в 2007 году её группе удалось смастерить псевдовирус из вируса СПИДа, присоединив к нему шип от коронавируса. Они выяснили, что шип неспособен раскрыть АСЕ-2 рецептор. Но после замены области связывания рецептора на ту, что есть у SARS, получилось. Так стало ясно, что нужно сделать, чтобы сделать вирус заразным для человека. Впрочем, это был не первый подобный опыт. С химерами "игрались" голландцы уже в далёком 1999 году. А доктору Баричу удавались ещё более прорывные вещи на его "воздушных" культурах из человеческих клеток.


Впрочем, необязательно пользоваться человеческими клетками. Да и трудно судить по небольшой культуре о состоянии всего организма. Для этих целей в 2007 вывели гуманизированных мышей. У этих мышей есть АСЕ-2 рецепторы, как у человека. А то ведь SARS-ом обыкновенные мыши не заражались. Прошло немного времени, и уже в 2016 году доктор Барич заражал своих "гуманоидов", которые умирали на четвёртый-пятый день. Этими мышами Барич делился и с лабораторией Бэтвумен в УИВ.


С таким ценным материалом процесс синтеза новых патогенов пошёл как по маслу. Учёные создавали всё новые химеры из имеющихся коронавирусов, и эти химеры успешно "работали". Исходного материала для создания химер становилось всё больше по мере нахождения всё новых штаммов в Моцзяне. Этими штаммами Бэтвумен делилась с Баричем. В разгар вышеупомянутого моратория он опубликовал статью, демонстрирующую способность SARS-вируса подковоноса вызвать эпидемию у людей. Эти два человека идеально подошли друг другу: у одного было всё пополняющееся на деньги Дашака сырьё, а другой лепил из него химер. Дашак хвастался этим сотрудничеством в декабре 2019 года:

Ты можешь очень легко манипулировать [коронавирусом] в лаборатории... Ты можешь взять последовательность [гена шипа], ты можешь выстроить белок, и мы работаем с Ральфом Баричем чтобы это сделать, вставить в основу другого вируса.

При этом оказалось, что химера с шипами от одного коронавируса на основе другого коронавируса получалась более вирулентной. Одним словом, был продемонстрирован потенциал возникновения опасного патогена в природе. А также риск при экспериментах подобного рода в лаборатории. Добро пожаловать в настоящее. А как же мораторий? А никак. Ведь он не только позволял обходить его, но и истёк пару лет спустя после прихода к власти Трампа.


Чего ради надо было заниматься столь опасным делом? Главной целью было использование полученных знаний для предотвращения будущих пандемий. Чем можно бороться? Правильно, вакциной. О создании вакцин говорили и Барич, и Дашак. Но ни в одной ключевой грантовой программе вакцины против SARS не были заявлены. Тем не менее планы в этом направлении существовали. Китайский грант XDB29010101 на срок до 2023 года вполне мог включать подобные работы.


А по ту сторону Тихого океана доктор Барич опубликовал в октябре 2018 года статью с предложением создания живой вакцины, которая бы работала против SARS-вирусов. Живые вакцины весьма эффективны: они размножаются и позволяют сохранять иммунитет длительное время. Однако есть опасность эволюции вакцины обратно в сильный патоген. Так бывает с вакциной против полиомиелита, например. Барич собирался вывести такой коронавирус, который бы не скрещивался с другими и таким образом не усиливался бы. К сожалению, своей цели он до начала пандемии достичь не успел.


Зато весь мир увидел, как легко и просто можно лепить вредоносные химеры. И не только увидел, но и, как пить дать, стал заниматься этим. Дело это, хоть и довольно сложное, но недорогое. Оборудование для печатания нужных генетических последовательностей сегодня не редкость и по карману любому олигарху средней руки. За всеми не уследишь.


Стоит заметить, что химеры конструируются из готовых природных вирусов. По этой причине практически невозможно по имеющемуся геному сделать вывод, что перед нами - химера или какой-то неизвестный вирус. Короче, доказать, что пандемийный коронавирус - продукт синтеза,  глядя лишь на его строение, не получится.


Это всё добро можно использовать в качестве биологического оружия. Опасения, что ковид-19 явился продуктом секретных программ, появились после того, как из Китая сбежал одна молодая исследовательница-биолог. Она с самого начала стала что-то подозревать и критиковать начальство за сокрытие информации о заразности ковида. На что ей посоветовали молчать и быть осторожной. Она слила информацию гонгконгскому оппозиционному ютюберу, который стал вещать не только о передаче вируса от человека к человеку, но и о разработке био-оружия. Когда доктор Янь Лимэн сбежала в США, она попала в зависимость от трампистов, которые приспособили её для своих целей. В любом случае, несмотря на личную убеждённость, она не смогла предоставить серьёзных оснований говорить о программе намеренного выпуска вирусов-убийц.

Вирус (4) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Пандемия, Биологическое оружие, Исследования, Вирус, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Доктор Янь Лимэн


Тем не менее, секретные исследования в интересах военных ведутся в Ухане как минимум с 2017 года. Об этом в 2021 году заявил Госдеп США. Но авторы считают, что скорее всего произошла утечка не вакцины (как  с русским гриппом в 1977 году), а результатов исследования свойств вируса. Тем более, что не было никакого смысла выпускать особо вирулентный и заразный вирус в большом городе, в котором расположена сама лаборатория.


--------------------------


Лично я не стал бы отметать версию о том, что ковид-19 - биологическое оружие. Оно могло просто вырваться на свободу в процессе разработки в результате утечки. Не стоит забывать, что  в исследования как минимум 39 миллионов было вложено Пентагоном. Вирус-убийцу нет смысла пускать в ход, если нет противоядия для своих. А именно - вакцины. Метод такой: сначала прививаем своих - а потом выпускаем вирус. Вакцины не было ни у кого. Болели премьер-министры, главы государств и олигархи без исключения. Трамп болел.


Однако вакцину-то и собирался делать доктор Барич! Он просто не успел. На сегодняшний день в мире создано уже множество всяких-разных вакцин, но все они оказались недостаточно эффективны в остановке пандемии. Наиболее эффективным оказался... Омикрон-штамм самого SARS-CoV-2. Но касательно его тоже можно поставить вопрос: естественного ли он происхождения? Может, доктор Барич постарался? Даже если принять, что Омикрон специально сделали в лаборатории, чтобы остановить пандемию, придётся иметь в виду то, что сказали авторы: живые вакцины, а также слабые штаммы способны эволюционировать в более вирулентные. Остаётся надеяться, что с Омикроном такого не случится.

Показать полностью 2

Вирус (3)

Продолжаем знакомиться с книгой Аниты Чан и Мэтта Ридли "Вирус. Поиск происхождения Covid-19."

Все части сложены здесь.


Коротко для ЛЛ: долгие годы китайские учёные коллекционируют вирусы из дикой природы. Занимаются этим они не самостоятельно, а в тесном сотрудничестве с западными учёными и спонсорами. В то же время патогены имеют свойство непрестанно вырываться на свободу из стен лабораторий. Пандемия коронавируса вполне могла быть результатом подобного случая.


В последние десятилетия в мире не было более обильного источника поступления новых вирусов, чем летучие мыши: Хендра, Нипах, SARS, MERS, Эбола... На это есть несколько причин. Во-первых они млекопитающие, и вирусу легче с них перескочить на человека. Во-вторых, они не одомашнены. В-третьих, ведут ночной образ жизни. В-четвёртых, часто живут плотными стаями в отдалённых пещерах. И в-пятых, мигрируют на большие расстояния. Наконец, вирус в теле летучей мыши не всегда встречает воспалительную реакцию, что может объясняться более высокой температурой тела. Это всё приводит к тому, что они являются идеальной средой для выведения вирусов, которые выплёскиваются в человечество при редких контактах.

Вирус (3) Книги, Обзор книг, Медицина, Пандемия, Коронавирус, Вирус, Безопасность, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Большой подковонос


Неудивителен интерес биологов к материалам летучих мышей, хотя с ними надо обращаться с большой осторожностью ввиду опасности латентных вирусов. Наибольшую активность в мире проявляет Уханьский институт вирусологии (УИВ). После эпидемии SARS в 2002-3 годах они начали охоту за вирусами в пещерах и заброшенных шахтах, нарушая покой тамошних жителей. В этом уханьцам помогали зарубежные партнёры, такие как доктор Линфа Ванг, прозванный за свою активность Batman. Уже известную нам доктора Ши Чжэнли прозвали Bat Woman. Исследования стоят денег. Гранты подкидывал ещё один партнёр - доктор Питер Дашак, президент штатовской EcoHealth Alliance. Эта общественная организация канализирует средства из других источников, в том числе в весьма значительной степени - из Пентагона, от которого за предпандемийные семь лет поступило 39 миллионов долларов.

Вирус (3) Книги, Обзор книг, Медицина, Пандемия, Коронавирус, Вирус, Безопасность, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Бэтвумен


Поиски в пещерах Юньнаня привели к открытию предка SARS, способного использовать человеческий рецептор ACE2. Более того, впервые удалось изолировать живой вирус, заставив размножаться в лабораторных условиях. Это сделало возможным культивацию новых штаммов. Список успехов пополнила локализация источника SADS - острого диарейного синдрома свиней. Всё это было достигнуто, благодаря многолетним сборам проб в дикой природе, хранению образцов в лаборатории и тестированию их на клетках различных животных и органов.


Пробы отбирались не только у животных, но и у людей, особенно у тех, кто подвержен контактам с летучими мышами. Ничтожный процент имел антитела к SARS, и ни у кого не было симптомов. Результат: в сентябре 2019 вышла статья, заключающая о низкой вероятности попадания коронавируса от летучей мыши к человеку. Прошло всего несколько месяцев, и один из соавторов статьи, тот самый доктор Дашак, стал говорить обратное, подчёркивая обыденность переноса. Следует отметить, что особенному риску подвергаются сборщики проб. Они рискуют стать нулевыми пациентами новых эпидемий, собирая кал под "золотым дождём" в пещерах, хватая животных голыми руками и имея на себе порой лишь футболку и шорты. Чего уж говорить о масках. Отлавливаются и живые экземпляры. УИВ патентовал в 2018 году новую конструкцию клетки для них с описанием деталей кормёжки и размножения. Годом позже - устройство для быстрой перевязки и дезинфекции ран на пальцах. Ещё годом позже - процесс разведения летучих мышей с описанием отлова полусотни из них.


В сентябре 2019 года подошёл к концу проект Predict, в результате которого собрали 140 тысяч проб и идентифицировали свыше тысячи вирусов. Но ещё до того был запущен ещё более амбициозный Global Virome Project, в рамках которого решили идентифицировать ВСЕ вирусы на планете, которые имеют эпидемический потенциал. Возражения скептиков о том, что это не поможет нам избежать эпидемий, доктор Дашак встречал решительным протестом, указывая на прогресс с SARS, секвенирование пепломеров и прочее изучение патогенов.


Казалось бы, пусть изучают, тем более дело это не столь уж затратное. Проблема в том, что зараза эта весьма опасна, а метобы обращения с ней настолько затруднительны, что случаются ошибки, приводящие к утечкам. Оригинальный SARS вырывался из лабораторий несколько раз: в 2003 году в Сингапуре и на Тайване и несколько раз - в Пекине. Исследователи заражались от образцов, убирали мусор, не нося средств защиты. Иногда неизвестно, каким образом произошло заражение. Одна пекинская студентка после работы в лаборатории поехала на поезде к маме, где почувствовала недомогание. Она вернулась назад в Пекин, где обратилась в больницу. Там и диагностировали вирусную пневмонию. За ней ухаживала мать, которая тоже заболела (и потом умерла). И даже после этого они обе снова сели на поезд и поехали обратно из Пекина домой. Тогда тысяча человек очутились в карантине. Пекинскую лабораторию SARS пришлось закрыть.


У современного SARS-CoV-2 инкубационный период может длиться до двух недель. Да ещё симптомы у него разнообразные. Если бы он вырвался из лаборатории - его могли бы месяцами не замечать. Уже в ноябре 2019 года трём работникам УИВ стало настолько плохо, что их положили в больницу. Уже после начала пандемии один из исследователей в Пекине подхватил ковид у себя в лаборатории, где он исследовал новый вирус.


Более того, если бы даже утечку своевременно обнаружили, не факт, что о ней бы дали знать остальному миру. 19 апреля прошлого года из сафари-парка китайского Ханчжоу сбежало три леопарда. Власти, конечно, хватились и кинулись ловить. А вот местных жителей не известили: не хотели отрицательной рекламы для парка. Кончилось тем, что жители сами начали фоткать зверей у себя "в гостях" и выкладывать в Сеть. Даже после этого отпирались, но в конце концов пришлось извиняться.


Хотите ещё историй? Да пожалуйста! В китайском Куньмине в 2003 году "бракованные" лабораторные крысы кусали студентов, которые с ними работали, и заражали их ханта-вирусом. Партия больных крыс была поставлена трём разным заказчикам. Тот случай расследовал не кто иной, как Бэтвумен. В Ланьчжоу в результате утечки с фабрики вакцин в ноябре 2019 года 10 тысяч человек получили бруцеллёз. Фабрика пользовалась просроченным составом для дезинфекции, и живые бактерии уходили в вытяжку.


Подобная фигня творится по всему миру. В 2019 году были прекращены исследования в американском армейском бактериологическом центре Форт Деррик после того, как были выявлены недостатки в водоочистке. Всего в этом году было зарегистрировано 219 утечек, из них 13 относятся к "секретным агентам" наподобие сибирской язвы, эбола, SARS и т.д. В Британии оспа вырывалась на свободу три раза, заразив 80 и убив три человека. В России в 1990 году лабораторный работник подхватил марбургский вирус. Это было уже при гласности. А до неё на заводе бактериологического оружия в Свердловске в апреле 1979 года работник снял фильтр на вытяжке в конце смены и не заменил его. Написал записку для сменщика, которую тот не заметил и включил машину. 64 трупа вследствие сибирской язвы. И это хорошо, что ветер дул не в центр города. Вы когда-нибудь слышали об этом случае? Неудивительно: вся эта история скрывалась 13 лет, больничные карточки изымались, а вину свалили на испорченное мясо.


Да, это всё - локальные случаи. Но в 1977 году мир облетел "русский грипп", который поражал в основном молодёжь и детей. Я лично помню эту эпидемию. В садиках тогда объявляли карантин, поликлиники увешали плакатами, а по телеку учили, как ухаживать за больным в домашних условиях. Русским этот грипп назвали потому, что первым в ВОЗ о болезни заявил Советский Союз. Казалось бы, ну грипп и грипп, бывает. Но когда проанализировали геном, то выяснилось, что штаммы H1N1, на него похожие, происходят из 1950 года! Потому-то и болела в основном молодёжь: иммунная система пожилых была знакома с этим штаммом. (Лично я сомневаюсь в этом аргументе. Ведь иммунитет к гриппу долго не держится. Прививаться приходится каждую осень.) Но, как бы то ни было, эта история оказалась следствием попытки КНР разработать вакцину против гриппа. Они взяли этот старый штамм и ослабили его.  И начали прививать солдат в трёх разных частях. А ослабленный вирус вакцины оказался способен к размножению. И пошло-поехало, сразу во всех трёх местах. Сто тысяч заражённых, пять смертей. Ну и мировая пандемия в придачу. Официально эта история не признана, но то такое...


Конечно, лабораторное происхождение ковида заподозрили сразу многие специалисты. Пошли спекуляции. Пришлось вмешаться Бэтвумен:

Новый коронавирус 2019 года – это природа, наказывающая человеческую расу за сохранение нецивилизованных жизненных привычек. Я, Ши Чжэнли, клянусь своей жизнью, что это не имеет никакого отношения к нашей лаборатории. Я советую тем, кто верит и распространяет слухи из вредных источников в СМИ, а также тем, кто верит в ненадежный так называемый академический анализ индийских ученых, заткнуть свои вонючие рты.

Доктор Дашак тоже стал с ходу отрицать лабораторную версию. Ещё бы: тогда получится, что его организация спонсировала пандемию. Он принялся рассылать электронные сообщения коллегам-медикам, чтобы они подписались под совместным заявлением, протестующим против "слухов, дезинформации и теориям заговора", которые предполагали лабораторное происхождение ковида. Как он сам был уверен в этом в то время, как не прошло и месяца с момента публикации генома - загадка.


В принципе, были и хорошие известия. В 2018 году УИВ получил лабораторию высшего класса безопасности BSL-4. Французы помогли построить. Тех завлекли обещаниями совместных исследований. И, в принципе, не обманули. Пригласили французского специалиста. Одного. Но сразу после начала работы лаборатории пошли нарекания со стороны американцев. Особенно, если дело касалось квалифицированности кадров. Практики китайских исследователей и в самом деле бывали весьма сомнительные. Кое-кто не чурался продажи бывших подопытных животных. Проблемы были и с избавлением от патогенного мусора.

Вирус (3) Книги, Обзор книг, Медицина, Пандемия, Коронавирус, Вирус, Безопасность, Конспирология, Нон-фикшн, Длиннопост

Работа в лаборатории с BSL-4. Кадр из фильма Заражение.


В охоте за природными штаммами вирусов к 2019 году УИВ "намайнил" двадцать тысяч проб. За период с 2010 по 2015 годы нашли 630 новых коронавируса! Результаты были сложены в базу данных онлайн. По адресу batvirus.whiov.ac.cn лежало ни много, ни мало - 61,5 мегабайт. Уже не лежат. С 12 сентября 2019 года. Бэтвумен обосновала удаление "соображениями безопасности". При этом она упомянула, что данные были загружены и в американскую базу GenBank. Но, похоже, не все: о ближайшем известном родственнике ковидного вируса RaTG13 стало известно лишь после начала пандемии. Об этом не знал даже доктор Дашек. Учёные мира многого добились бы, если бы сегодня доступ восстановили, но нет. Вместо этого усилились подозрения, что есть что скрывать


------------------------------


Как видим, лабораторную версию исключать никак нельзя. Однако эта версия на самом деле имеет две подверсии: что за патоген вырвался на свободу - изолированный природный вирус или нечто сконструированное? Об этом - в следующей части.

Показать полностью 3

Вирус (2)

Продолжаем знакомиться с книгой Аниты Чан и Мэтта Ридли "Вирус. Поиск происхождения Covid-19."


Все части сложены здесь.


Коротко для ЛЛ: версия о происхождении вируса из дикой фауны, торгуемой на рынке морепродуктов в Ухане, оказалась несостоятельной. Сам приход вируса из дикой природы вызывает много вопросов и недостаточно обоснован.


Начало пандемии в Ухане сопровождалось попытками китайский властей скрыть её. 30 декабря 2019 года докторам стало ясно, что атипичная пневмония вызвана SARS-вирусом. Врачи в уханьской центральной больнице стали пересылать коллегам и одноклассникам результаты тестирования. Последовала инструкция Уханьской комиссии по здравоохранению: ничего не публиковать. Которую тоже сразу слили онлайн. 31 декабря уханьский рынок морепродуктов был закрыт и полностью дезинфицирован (предварительно, конечно, собрали пробы). На следующий день началась охота на "паникёров". Их увольняли с работы и таскали на допросы в полицию, заставляя подписывать протоколы о предупреждении за ответственность. Прошла недели, и один из восьмерых наказанных, доктор Ли, заболел ковидом и умер в возрасте 33 лет, оставив после себя беременную жену с ребёнком.


Это всё не осталось незамеченным с Тайваня, который отправил свою группу экспертов в Ухань 13 января. У них не осталось сомнений в передаче вируса от человека к человеку, хотя Китай и ВОЗ на тот момент говорили, что свидетельств тому нет. Тайвань сразу же ужесточил пограничный контроль.


Сегодня ясно, что эпидемия началась задолго до кануна нового 2020 года. Генетический анализ позволил прикинуть появление общего предка для всех штаммов коронавируса на период с сентября по ноябрь 2019 года. К сожалению, трудно сегодня заниматься поисками: китайский Минздрав приказал больницам и лабораториям уничтожить все ранние образцы из соображений биологической безопасности. Первый подтверждённый случай был 17 ноября с 55-летним жителем провинции Хубэй неизвестного рода занятий и места жительства.


Между тем до того, в октябре, в Ухане состоялись Всемирные военные игры. Позднее атлеты из разных стран, вернувшись домой, жаловались на то, что в Ухане они болели с температурой, кашлем и диареей. Некоторые оказались выбиты из строя на несколько недель. Но не будем спекулировать. Сегодня трудно оценить, сколько на самом деле заболело в том же декабре: сообщения почти невозможно верифицировать. Данные о ранних версиях генома были удалены самими китайцами из глобальной базы данных где-то в конце июня 2020 года. При этом они отказывались отвечать на запросы, почему это сделано. Но доктор Джесс Блум знал: Интернет помнит всё. Он восстановил львиную долю информации из следов, оставленных в облаке. К сожалению, это был не полный геном, а лишь его фрагменты. Тем не менее, их хватило, чтобы заключить: пробы с рынка морепродуктов имеют с этими фрагментами мало общего. Только после широкой публикации результатов доктора Блума с призывом к поиску ранних проб по всему миру 21 июля 2021 года китайцы стали ссылаться на то, что данные удалены по ошибке редакции и втихаря загрузили их обратно.


Публикация результатов секвенирования генома вируса в январе 2020 года тоже была сопряжена с трудностями. На данные было наложено эмбарго до 12 июля. Одна из предполагаемых причин - стремление сохранить монополию на производство тестов и вакцин. Но долго это эмбарго не продержалось: в преддверии неминуемого скандала доктор Чжан загрузил геном на сайт virology.org. И уже через пару дней, 13 января, тогда ещё малоизвестная фирма Moderna закончила разработку предварительной версии своей вакцины. А за день до того лаборатория доктора Чжана была закрыта "для очистки". Ведь ещё 3 января всем лабораториям было предписано уничтожить все имеющиеся образцы или отправить их в компетентные органы.

Вирус (2) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Ухань, Медицина, Конспирология, Пандемия, Вирус, Панголин, Нон-фикшн, Длиннопост

Профессор Чжан Йонгжен


Конечно, после этого сокрытие данных только ужесточилось. Научные публикации, касающиеся пандемии, стали подвергаться цензуре перед выходом в печать.


Что было потом в Китае и в мире, начиная с запоздалого локдауна в Ухане (23 января) - хорошо известно. Я рассказывал об этом здесь.


С самого начала были спекуляции об уханьских лабораториях как о предполагаемом месте распространения инфекции. Но главной версией был тот самый рынок морепродуктов. В этом были убеждены китайские власти, буквально залившие его дезинфекционным составом ещё в 2019 году. Тем не менее двумя неделями позже им пришлось признать, что летучих мышей там не было, и вообще, в провинции Хубэй их не едят. Почему тогда взялись за этот рынок с самого начала? Дело в том, что уже была эпидемия SARS 2003 года, и она была сконцентрирована вокруг мест контакта с дикой фауной: рынков и ресторанов. Китайцы, как известно, любят экзотическую еду. Тогда выяснилось, что максимальным уровнем антител к вирусу обладают торговцы дикими животными, и не всеми подряд, а виверровыми.

Вирус (2) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Ухань, Медицина, Конспирология, Пандемия, Вирус, Панголин, Нон-фикшн, Длиннопост

Азиатская цивета (виверра)


Как оказалось, те тоже болеют и переносят SARS. И заражают ими людей. Более поздние случаи заражения свидетельствовали о том, что эпидемия продолжается за счёт новых случаев заражения от животных. В результате было уничтожено свыше десятка тысяч виверр. Впоследствии нашли всё же наиболее вероятного изначального носителя SARS. Это были летучие мыши вида Rhinolophus sinisus. Вот тогда, в 2005 году, летучая мышь и стала главным подозреваемым.


Рассказав про SARS, трудно удержаться, чтобы не упомянуть и про MERS, от которого умирал каждый третий инфицированный. Этот смертельный коронавирус был изолирован в 2012 году в Саудовской Аравии. И тогда "оригинал" нашли у летучих мышей, но человеку он передался, скорее всего, от верблюдов, которые переносили его, как минимум, с 1983 года.


Китай является традиционным фактором риска в плане эпидемий в силу ряда причин, одной из которых является использование дикой фауны в китайской традиционной медицине (КТМ). В 2019 году КТМ с подачи Китая была признана как форма медицины не кем иным, как Всемирной организацией здравоохранения. Рынки сбыта распространяются по всему миру, особенно в Африке. В октябре 2019 года, за недели до вспышки ковида, председатель Си заявил:

Традиционная китайская медицина - сокровище китайской цивилизации, которое несёт в себе великую мудрость китайского народа.

Конечно, летучая мышь, а также её экскременты, тоже входят в ряд рецептов. Их сушат, перемалывают в порошок и употребляют в целях избавления организма от шлаков.


Но первые подозрения пали на змей, в изобилии имевшихся на рынке морепродуктов. Однако змея - это рептилия, которая вряд ли способна подхватить вирус от млекопитающего, не говоря уже о передаче вируса человеку. Если искать - то искать у теплокровных. Гипотезу со змеями быстро отбросили. Нужно было искать нового промежуточного хозяина SARS-Cov-2, подобного виверрам и верблюдам с SARS и MERS. Забегая вперёд, скажу: где и от кого нулевой пациент подхватил ковид, остаётся неизвестным по сей день. Ни у одного из протестированных животных с рынка морепродуктов не нашли следов коронавируса. Поиск источников в обороте дикой фауны завёл в тупик. Рынок морепродуктов послужил лишь для распространения вируса от человека к человеку в условиях толпы и плохой вентиляции.


Эрудированный читатель спросит: "А как же панголин?" Начиная с 7 февраля 2020 года стали появляться сообщения, что у проб, взятых у этих экзотических животных, обнаружено 99%-сходство с SARS-Cov-2. Однако быстро выяснилось, что эти 99% относятся не ко всему вирусу, а лишь к одному фрагменту. А сходство всего вируса не превышает 90%. То есть наиболее похожий вирус - всё ещё тот же RaTG13 из публикации 2016 года.

Вирус (2) Книги, Обзор книг, Коронавирус, Ухань, Медицина, Конспирология, Пандемия, Вирус, Панголин, Нон-фикшн, Длиннопост

Малайский панголин


Это бедное животное истребляется из за своего панциря, который защищает его от хищников. Состоит он из кератина и используется в молотом виде в КТМ как средство против рака, импотенции, воcпалений и недостатка молока у кормилиц. Научного подтверждения тому нет. С тем же успехом можно есть обрезки ногтей, которые состоят из того же кератина. В 2019 году в одном лишь Сингапуре в результате трёх рейдов было конфисковато почти сорок тонн чешуи панголина. Вдумайтесь: сорок тонн! Это соответствует многим десяткам тысяч особей.


В марте 2019 года в результате облав китайская полиция конфисковала 155 контрабандных панголинов, из которых 103 были ещё живы. Два десятка были больны и почти все передохли. Одиннадцать трупов подверглись исследованиям на вирусы, которых обнаружили в количестве четырнадцати семейств. У двоих нашли коронавирус, что позволило учёным предполагать их в качестве потенциального промежуточного носителя. Статья вышла осенью 2019 года, ещё до пандемии.


Проблема в том, что коронавирус вошёл в пандемию уже хорошо приспособленным к человеческому организму. Если в эпидемию 2003 года SARS характеризовался широким разнообразием штаммов, из которых впоследствии выживали лишь некоторые, то ранние версии SARS-CoV-2 были удивительно похожи друг на друга и не демонстрировали следов приспособительных мутаций. При этом не удалось найти ни ближайших родственников, ни предков вируса. Неудивительно, что на рынке морепродуктов не заразилось ни одно животное: вирус-то человеческий оказался.


Алина написала об этом научную статью и получила ценный совет от одного из анонимных читателей, что все сообщения о панголине как возможном промежуточном носителе базируются на одной и той же партии, конфискованной в марте 2019. Да-да,это те самые панголины, у который нашли похожий фрагмент генома. Откуда получили эти двое особей коронавирус - трудно сказать. Но можно с уверенностью сделать вывод, что респираторный вирус эти живущие в одиночестве звери не переносят. Тем более, что ни их, ни летучих мышей на рынках Уханя не продавали.


Но то, что исследования коронавирусных образцов панголинов в УИВ велись - несомненный факт, подтверждаемый статьёй, опубликованной осенью 2019 года. Что происходило с образцами вирусов - может оставаться лишь предметом спекуляций в условиях тотальной скрытности китайских властей.


А как же панголины? Может, их оставили в покое после всего случившегося? Увы, запрет на торговлю дикой фауной, установленный в 2020 году Китаем, не касается лекарственных целей, и продукты из панголина можно найти на онлайн-прилавках и сегодня. Панголинов допускается разводить, как и тигров с медведями, в неволе, что позволяет браконьерам отмывать свою добычу. Трафик из Малайзии не прекратился. Удивительно, особенно для страны, которая до сих пор настаивает на происхождении мировой пандемии из практик торговли и содержания диких животных.


-----------------------------


Хочу извиниться перед читателем за длинный пост. Опровержение мифов часто требует внедрения в детали. Но зато я думаю, что теперь понятно, почему версия естественного происхождения SARS-Cov-2 вызывает столько скептицизма и привлекает конспирологов. Слишком много концов не сходится - это раз. Тотальная скрытность китайцев - это два. Потоки дезы - это три. Это жжж - неспроста. Но всё же напомню: не пойман - не вор. А ловить придётся долго...

Показать полностью 3

Вирус (1)

Доброго времени суток, уважаемые!


Вообще-то, я не хотел читать эту книжку. Уж сколько написано про коронавирус, конспирологии и не очень. Пока не заметил, что имя одного из авторов - Мэтт Ридли - мне знакомо. Я уже рассказывал о его книге об инновации в прошлом году. Доброе имя Мэтта подвигло меня на чтение. Оказалось, не напрасно. Книга увлекательная, читается как детектив. Да это, по сути, и есть детектив.

Вирус (1) Книги, Обзор книг, Биология, Коронавирус, Пандемия, Конспирология, Медицина, Вирус, Нон-фикшн, Длиннопост

Вирус. Поиск происхождения Covid-19.


Второй автор - американская биолог китайского происхождения Анита Чан. После выхода книги она стала задумываться о перемене фамилии - задолбали хейтеры из Китая. Вы догадаетесь, почему.


Коротко для ЛЛ: ближайший родственник современного коронавируса происходит из заброшенной шахты на юго-западе Китая, где многократно ковырялись уханьские вирусологи. Между тем - коронавирусы не новы. Их знают уже почти полвека, а сегодня они одни из наиболее изученных.


Весной 2012 года в куньминскую больницу,что в столице китайской провинции Юньнан, поступили шесть пациентов с сухим кашлем, температурой, одышкой, мышечной и головной болью и слабостью. Троим удалось выжить: они были моложе, а также провели меньше времени на работе. Их профессия - шахтёр. Они очищали заброшенную шахту от помёта летучих мышей, угнездившихся в ней. В 2011 году цены на медь на мировом рынке подскочили, и, по-видимому, кому-то пришла в голову идея восстановить добычу.


Не стоит думать, что тот случай прошёл незамеченным для китайских вирусологов. Подключились ведущие специалисты, которые своими рекомендациями помогли спасти жизнь одного из тяжелобольних. К счастью, никто от больных не заразился. Похоже, тот штамм не передавался между людьми. Уже тогда зашла речь о SARS-вирусе.  Заражение привлекло внимание ведущих лабораторий, включая Уханьский институт вирусологии (УИВ). Как минимум три экспедиции посетили шахту. Самыми настойчивыми оказались специалисты УИВ под руководством доктора Ши Чжэнли.


Были написаны научные диссертации. Которые были раскопаны самодеятельными интернет-расследователями. Некто Seeker, он же учитель из Индии, разрыл работу 2013 года в китайской базе данных с подробным описанием юньнаньской саги. А в докторской диссертации замдиректора Пекинского CCDC, которая была опубликована три года спустя, оказались приведены точные географические координаты той шахты. N 23°10'36" E 101°21'28"

Вирус (1) Книги, Обзор книг, Биология, Коронавирус, Пандемия, Конспирология, Медицина, Вирус, Нон-фикшн, Длиннопост

Местоположение шахты в Моцзяне


Прошли годы, и вот уже в октябре 2020 корреспонденты Би-Би-Си вознамерились снова потревожить покой летучих мышей по вышеуказанному адресу. У них не получилось. Без шансов: территория закрыта и плотно охраняется. Дороги заблокированы. Пошли пешком - напоролись на патруль, который дал понять, что их тут не ждут, и угрожать применить силу. Попытка проникнуть в пещеру по соседству тоже не удалась. Всё перекрыто.


Группа доктора Ши к моменту заражения шахтёров уже почти десять лет занималась поиском природного резервуара SARS. В 2013 году в Моцзяне был обнаружен новый SARS-вирус, фрагмент которого был опубликован в 2016 году под названием BtCov/4991. В ноябре 2020 года доктор Ши сообщила, что к 2015 году в шахте нашли ещё как минимум восемь (!) подобных вирусов. Но тогда, в 2016 году, даже те результаты, что вышли в печать, публиковались без особой помпы.


Учёные, секвенировавшие всем известный сегодня SARS-Cov-2, уже 8 января 2020 года обнаружили сходство (98,7%)  его фрагмента с тем самым 4991 из публикации 2016 года. Но двумя днями раньше сама доктор Ши сообщила о том, что новый коронавирус похож на SARS 2003 года почти на 80%. И лишь ниже упомянула о сходстве фрагмента генома с неким вирусом под названием RaTG13 (96,2%). Я не буду приводить здесь перипетии поисков интернет-активистов (главным образом доктора Росанны Сегрето), которые выяснили, что RaTG13 и 4991 - это одно и то же. Что признала, наконец, и сама доктор Ши в июле месяце.


Чего ради им нужно было скрывать? Наверное, чтобы не афишировать связь пандемии с публикацией 2016 года и смертью моцзянских шахтёров. BtCov/4991 полностью секвенировали в 2018 году, и когда обнаружили сходство с SARS-Cov-2, то решили "переименовать" при публикации, скрыв связь и с предыдущими исследованиями, и со случаем смертельной пневмонии у шахтёров. Позднее выяснилось, что пробы, взятые у шахтёров, всё это время скрытно сохранялись УИВ и были протестированы на сходство с "нашим" коронавирусом. Ещё позднее УИВ решил "переиграть" и сообщил, что шахтёры умерли от грибковой инфекции.


Переведём дух и поговорим об истории вопроса. Первой коронавирус увидела Джун Алмейда, которой в 1964 году прислали на исследование образец, взятый из носа простудившегося английского школьника. Джун была непревзойдённым специалистом по электронным микроскопам. Когда она увидела шар с короной, то немедленно вспомнила, что видела нечто подобное у мышей и кур. И хоть в публикации статьи ей отказали, после дополнительного сбора данных журнал Nature всё же напечатал сообщение о новом классе вирусов, который назвали коронавирусами. Сегодня нам известно, что коронавирусов - четыре типа. Самые редкие - гамма и дельта - людей не заражают. Чаще всего попадается альфа. Она встречаются в основном у млекопитающих, и два версии - 229Е и NL63 - вызывают простуду у людей. Бету часто можно встретить у летучих мышей и грызунов,  и четыре версии - HKU1, OC43, MERS и SARS - поражают человеческий организм. Последний известен также как сарбековирус.

Вирус (1) Книги, Обзор книг, Биология, Коронавирус, Пандемия, Конспирология, Медицина, Вирус, Нон-фикшн, Длиннопост

Первооткрывательница коронавирусов Джун Алмейда


Вирусы настолько малы, что их обнаружили лишь через две сотни лет после бактерий. Учёные обнаружили болезнь табака, которая не вызывалась бактериями или грибком, но неким невидимым заражением. Для которого Мартин Бейеринк и придумал подходящее название, произведённого от латинского слова, обозначающего жидкий яд.


Человек может заразиться через еду или укус насекомого, например. Но чаще всего в развитых странах заболевают респираторными инфекциями, то есть через органы дыхания. Обычный ребёнок простужается в среднем семь раз в году. Скученная жизнь в городах с их барами и школами, а также дальние путешествия, способствуют распространению ОРВИ. Не случайно, что ещё одно млекопитающее, переносящее огромные количество вирусов - тоже живёт огромными толпами. Да, это летучие мыши. В одной техасской пещере в определённое время года можно насчитать 20 миллионов особей.


Прогресс в микробиологии позволил быстрое секвенирование генома вирусов. Поскольку вирусы мутируют постепенно, можно отследить процесс их эволюции. Подобный анализ делали уже в девятнадцатом веке с текстами Шекспира, в который нашли массу фрагментов, вписанных его последователями. Пандемийный коронавирус является на данный момент одним из наиболее изученных вирусов планеты. И всё равно до сих пор все его тайны не раскрыты. В клетку он проникает при помощи пепломера, или белка его шипов. На этом шипе находится фрагмент, который заставляет клетку пропустить вирус в свой тело клеточным рецептором ACE2. Этот АСЕ2 нужен человеку главным образом для регуляции кровяного давления. Как результат - сосуды и лёгкие буквально кишат этими рецепторами. Но не только они: АСЕ2 есть и в сердце, почках, печени, нервных тканях и т.д. Потому-то те, у которых эти органы уже ослаблены - гипертоники, например - относятся к ковидным группам риска.


АСЕ2 используют и другие вирусы. SARS-Cov-2 имеет, тем не менее, ещё уникальную особенность, которая называется сайтом фуринового расщепления, который позволяет инфицировать самые разные типы клеток, которые включают фермент фурин.


Проникнув в клетку, вирус избавляется от своей оболочки и заставляет посредством специальных белков превратиться клетку в фабрику для точного построения новых вирусов. Для коронавирусов они особенно важны, поскольку их геномы почти вдвое длиннее других РНК-вирусов.


Из четырёх видов коронавируса, встречающихся у людей, два получены от летучих мышей, и два - от грызунов. Самый распространённый - ОС43 - совпадает на 96% с коровьим вирусом BCoV. В результате анализа обоих вирусов выяснилось, что "разошлись они" примерно в 1890 году. В тот год, кстати, мир пережил пандемию русского гриппа. Начившись в Бухаре, она распространилась через Москву и Петербург по всему миру. Болели в основном люди в возрасте, и главным образом мужчины. Некоторые больные теряли вкус и обоняние. Улавливаете?


На вопрос о том, какие вирусы лучше распространяются: более или менее вирулентные, ответить не так-то просто. Чем тяжелее болеешь - тем больше вирусов носишь в себе. Но тем тяжелее и сам передвигаешься. Главное при этом - каким способом передаётся болезнь. Если через прямой контакт - то болезнь чаще всего лёгкая, чтобы иметь возможность передаться болеющим "на ногах". А вот если через воду или укусы насекомых - там можно схватить и что-то весьма серьёзное. Чуму, холеру, малярию не надо распространять самому больному. Болезни, передающиеся половым путём, способны долго прятаться в теле, чтобы у жертвы было время передать её партнёрам. Но есть и отдельная категория, распространяемая теми, кто ухаживает за лежащим больным. Эта категория тоже может быть высокой вирулентности.


В случае "нашего" коронавируса ещё не ясно, в какую сторону он будет эволюционировать (замечу, книга написана летом 2021 года, когда ещё не был Омикрона). Обычно респираторные вирусы легко переносятся, ведь им нужен прямой контакт. Но если у нас будет ситуация скученного пребывания тяжелобольных вместе со здоровыми - могут вывестись более штаммы с более тяжёлым протеканием болезни. Как это случилось с испанкой в 1918 году, первая волна которой была слабее второй: "помогла" Первая мировая с её переполненными окопами и госпиталями.


--------------------


Читается на одном дыхании, хоть и содержит массу всяких непонятных обозначений. Конечно, много неясностей. Конечно, какие-то вещи навроде усиления вирулентности "испанки" вследствие скученного пребывания не являются общепринятыми. Конечно, китайцы могут шифроваться по каким-то другим причинам. Но важно указать на свежие следы ещё до того, как их стирают. В этой ситуации можно порадоваться за то, что у нас есть Интернет, который не только помнит всё, но и позволяет объединяться единомышленникам во имя благородной цели. А правда... правда пробьёт себе дорогу рано или поздно.

Показать полностью 3
Отличная работа, все прочитано!