Необходимо войти или зарегистрироваться

Авторизация

Введите логин, email или номер телефона, начинающийся с символа «+»
Забыли пароль? Регистрация

Новый пароль

Авторизация

Восстановление пароля

Авторизация

Регистрация

Выберите, пожалуйста, ник на пикабу
Номер будет виден только вам.
Отправка смс бесплатна
У меня уже есть аккаунт с ником Отменить привязку?

Регистрация

Номер будет виден только вам.
Отправка смс бесплатна
Создавая аккаунт, я соглашаюсь с правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.
Авторизация

Профиль

Профиль

ItsHim

Пикабушник
Работаю в научно-прикладной отрасли, интересны темы той же науки, аниме, MMA, некоторых фанфиков
9 112 рейтинг
3530 комментариев
16 постов
3 в "горячем"
Показать полную информацию

Немного биотехнологии...

ItsHim в Биотехнология и молекулярка

Давным давно хотел запилить пост о работе в биотехнологической лаборатории ну и о том, чем эта самая биотехнология занимается, да вот только то одно, то другое и всё никак, а потом и вовсе забылось.

Недавно я решил повыделываться поиграть в угадайку в посте https://m.pikabu.ru/story/geneticheski_modifitsirovannaya_ba... , где @MedVikt0r случайно напомнил мне, что я ленивая задница, поинтересовавшись, не могу ли я запилить посты по микрооргнизмам. Не смотря на то, что я немного не микробиолог, это заставило задуматься на тему прокрастинации и лени.

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Но, всё же, собравшись с духом и зарядившись кофейком, я сделяль.

Пост получится долгим, и кому данное направление не интересно, могут смело пролистывать эту скукотень.


Для людей, работающих в подобных лабах или имеющих непосредственное к ним отношение: многие детали я пропускаю, потому как люди бы заснули уже на понятиях интрон-экзонной структуры эукариотического генома и реакции обратной транскрипции.



Начну с малого - того, чем занимается лаборатория в которой я работаю. В большинстве случаев работа в нашей лабе упирается в получение белков с помощью микроорганизмов (экспрессионные штаммы могут быть самыми разными). Рабочей лошадкой для производства белков практически в любой лабе является E.coli она же Кишечная палочка. Геном изучен вдоль и поперёк, штаммов - великое множество, да и сам организм не особо сложен и привередлив.

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Итак с организмом-продуцентом мы определились, теперь можем подумать и о том, что бы нам вытащить. Как вариант у нас есть какой-то организм с флуоресцентным белком, позволяющим ему грубо говоря светиться. Организм наверняка эукариотический, так что это сулит нам немного больше геморроя, чем хотелось бы, но не время жаловаться, время вытаскивать ген, кодирующий этот самый белок.

У всех живущих организмов в каждой живой клеточке есть ДНК, которая является набором информации о совокупности всех его генов и попутно регуляторным инструментом, в котором прописаны инструкции к производству белков, которые на этих самых генах и основаны. Так же с начала 80ых годов мы пользуемся методом полимеразной цепной реакци (ПЦР) для того, чтобы многократно преумножить определённый участок ДНК/РНК. Из чего следует, что всё, что нам нужно, это выделить всю ДНК нужного нам организма, насколько это возможно, и поставить с ней ПЦР на нужный нам ген флуоресцентного белка. Схематически ПЦР выглядит примерно вот так:

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Есть у кого-нибудь возникнут вопросы о том, что это такое, из чего состоит процесс и почему юзается в диагностике, я могу ответить в комментах.


И вот, наконец-то вожделенный ген амплифицирован (многократно умножен) и готов к использованию. "Использование" на данной стадии представляет собой впихивание этого самого гена в вектор, который в большинстве случаев из себя представляет плазмида. Плаздима - это очень небольшая закольцованная молекула ДНК. Сегодня в нашем распоряжении есть огромное множество этих плазмид под самые разнообразные нужды и для самых разнообразных организмов. В самой плазмиде есть ген резистентности к определённому антибиотику, промотор для начала транскрипции и, как следствие наших манипуляций именуемых молекулярное клонирование, в плазмиде появляется и наш ген. Схематически выглядит примерно так:

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Остальные надписи вообще смысла не имеют объяснять долго, но если кому будет интересно - отпишу.


Зачем мы в принципе запихали наш ген в плазмиду? Есть сразу несколько причин.

Первая - чтобы нашу вставку просто так не пошинковала клетка, которую мы собираемся трансформировать. Плазмида в данном случае - система доставки.

Вторая - чтобы контролировать экспрессию нашего гена. В плазмиде, как уже описывалось выше есть промотор, от силы которого будет зависеть то, сколько синтезируется нашего белка.

Третья - чтобы отобрать нужные нам клетки в последствие. Плазмиды имеют свойство не только "влетать" в клетку, но и так же благополучно деградировать в ней.

Поэтому, чтобы быть уверенным в том, что наша плазмида точно находится в клетках, которые мы с такой любовью растим, мы добавляем в среду немного йаду - а именно антибиотик, к которому в нашей плазмиде есть ген резистентности, и которого нет в геноме самой бактерии. Таким образом все клетки БЕЗ нашей плазмиды, коих наверняка сыщется не один миллион, тихонько помрут за ненадобностью (ох уж эти люди, ни дня без геноцида). Ну и классическая чашка с колониями:

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Вот и готов наш ГМО (=


Далее мы берём клетки одной из проросших колоний и кидаем их в питательную среду всё с тем же антибиотиком и растим, попутно добавляя индуктор. Индуктор нужен для того, чтобы запустить процесс наработки нашего белка. После инкубации в питательной среде наших клеток с нашей плазмидой, в которой сидит наш ген флуоресцентного белка... о как завернул... в общем после всего этого мы выделяем наш белок из клеточной массы (например, методом металл-аффинной хроматографии) и выглядит он примерно так же как и вот эти ребята:

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Ну и дополнительно можно растить эти клетки сразу на чашке с индуктором, тогда можно делать, вот такие приколы на Новый Год:

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост

Фото этой чашки, кстати, было моим первым постом на пикабу)


Кошка бонусом для тех, кто осилил пост до конца))

Немного биотехнологии... ДНК, Биотехнологии, Белок, ГМО, Длиннопост
Показать полностью 7

Опять пикабу в Казахстане забанили?

ItsHim в Пикабушники Казахстана

Пикабушники Казахстана, у вас пикабу нормально открывается? Может быть я не в курсе какого-то бана, но уже почти пол часа как сайт перестал грузиться. Ни с Теле2 4G, ни со стационарного билайна пикабу не открывается. Стоит подрубить vpn - всё пашет как по часам.

Есть у кого ещё подобные проблемы?


P.S. В приложении та же вата.

Сообщество Биотехнология и молекулярка

ItsHim в Создайте сообщество

Прошу создать сообщество "Биотехнология и молекулярка". Смысл создания - популяризация науки в целом, ликбез и объяснение некоторых научных фактов. На пикабу существует много постов вышедших в горячее, в которых объясняется то, чем люди занимаются в лаборатории молекулярной биологии, биохимии, биотехнологии, генетики, даже обычных диагностических лабах. Есть так же посты про ГМО, в которых многое объясняется для простого человека, далёкого от лабораторной деятельности. Сообщество позволит "упаковать" все эти посты, так же как и создавать новые в данной же тематике. На пикабу сидит много работников лабораторий, но выкладывать тематические посты - это всегда высокая вероятность улететь в минуса.


Шапка:

Сообщество Биотехнология и молекулярка Молекулярная биология, Биотехнологии, Генетика, Лаборатория

Аватарка (лучше ничего не нашлось):

Сообщество Биотехнология и молекулярка Молекулярная биология, Биотехнологии, Генетика, Лаборатория

Идея для будильника

ItsHim

Засыпая под свой плейлист в темноте, предвкушаю приятное "отключение основных систем". В полудрёме ещё не понимаю, что музыка почему-то затихла. И тут начинается композиция "let the bodies hit the floor". Просто послушайте начало и вы поймёте, что я ощутил в те самые 5-6 секунд.

Сижу бодрячком, листаю ленту; сна уже ни в одном глазу, а от шёпота меня теперь перебирает... Поставил на будильник. На пару недель хватит (=


А как вы просыпаетесь?

И снова кошка

ItsHim
Не ожидал такой бурной положительной реакции на мою кошку. Вот вам на суд ещё одно фото. Влетела в пакет с разгона, но похоже, что ей там понравилось.
И снова кошка Не ожидал такой бурной положительной реакции на мою кошку. Вот вам на суд ещё одно фото. Влетела в пакет с разгона, но похоже, что ей там понравилось.

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3

specials спoнсорский пост

Е3 — это крупнейшая выставка электронных развлечений и ежегодный праздник для всех любителей видеоигр. Пикабу не смог пройти мимо и запустил закрытую распродажу для геймеров. Классные скидки на товары и услуги и всего две недели, чтобы ими воспользоваться.

Игровая периферия от SteelSeries

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

Гарнитуры, мыши и коврики для них, клавиатуры, контроллеры – за этим можно идти к бренду SteelSeries, который поддерживает киберспортивные турниры. Вводите промокод SS10 и покупайте разные игровые устройства со скидкой 10% – без ограничений.


Ввести промокод (только перед этим зарегистрируйтесь)

Доставка еды от «Кухни на районе»

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

«Кухня на районе» идеально подходит, чтобы не отвлекаться от игры или стрима. Вы просто заказываете в приложении и за 25 минут получаете свою еду. Без минимальной суммы заказа и комиссии за доставку. Всем новым клиентам – скидка 500 рублей по пикабушному промокоду PIKABUE3.


Заказать еду

Автобусы на Daedu.ru

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

До Лос-Анджелеса, где проходит E3, на автобусе, конечно, не доехать, зато вот по стране и ближнему зарубежью прокатиться можно. Сайт Daedu.ru — это простой и удобный поиск самых дешевых билетов на автобусы. Вы просто задаете направление, а сервис ищет в интернете лучшее предложение.


Найти билет

Игровое кресло ThunderX3 EC3

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

Удобное кресло – важно всегда: и для работы, и для стриминга. Кресло ThunderX3 EC3 может похвастаться двумя подушками в комплекте (под поясницу и шею), механизмом «топ ган» и технологией AIR Tech – дышащей поверхностью, с которой летом не будет жарко. Главный плюс – раскладывающая спинка аж на 180 градусов. Когда надоест сидеть, можно прилечь.


Не забудьте перед заказом ввести промокод PIKABU20, который дает 20% скидку.


Купить кресло

Игры месяца в июне от PlayStation

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

Эксклюзивное предложение для подписчиков PS Plus в этом месяце включает две бесплатные игры для PlayStation 4:


Sonic Mania

Выход этой части был приурочен к 25-летнему юбилею серии игр о Сонике. Разработчики сохранили лучшие черты игрового процесса первых игр (с SEGA!), добавив новые возможности.


Borderlands: The Handsome Collection

Это сборник из игр Borderlands 2 и Borderlands: Pre-Sequel. Если вы никогда не играли в этот комедийный экшен, сейчас, в преддверие выхода третьей части, самое время наверстать. А тем, кто уже знаком с серией, стоит обратить внимание на новое бесплатное сюжетное дополнение «Командир Лилит и битва за Убежище», которое послужит мостиком к грядущей Borderlands 3.


Посмотреть игры месяца в PS Plus

Первая поездка на Uber Russia

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

Если еще не пользовались Uber Russia, тогда качайте приложение в App Store или Google Play. В разделе «Промокод» введите PIKABU, при заказе машины выберите оплату картой и наслаждаетесь скидкой 40% (максимальный размер скидки – 150 рублей). Акция действует до 14 июля 2019-го.

Товары для геймеров на goods.ru

Скидки на товары и услуги для геймеров (и не только) в честь E3 Длиннопост

Используйте промокод PikabuE3, чтобы получить выгоду 1000 рублей при покупке от 4000 рублей на первый заказ. Он работает с 14 июня по 30 июня 2019-го.


Промокод действует на все товары, но мы рекомендуем заглянуть в специальный раздел goods game и обратить внимание на акционные товары, спецпредложения, кэшбэк на все товары и многое другое.


Перейти в геймерский раздел

Показать полностью 5
Отличная работа, все прочитано!